Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Rpl28P41105 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Rpl28P41105 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Rpl28P41105 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Rpl28P41105 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.41□□□□□ -0.9
Rpl28P41105 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Rpl28P41105 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC9.41□□□□□ -0.9
Rpl28P41105 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Rpl28P41105 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Rpl28P41105 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Rpl28P41105 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Rpl28P41105 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Rpl28P41105 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.41□□□□□ -0.9
Rpl28P41105 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Rpl28P41105 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.41□□□□□ -0.9
Rpl28P41105 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Rpl28P41105 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC9.41□□□□□ -0.9
Rpl28P41105 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Rpl28P41105 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Rpl28P41105 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Rpl28P41105 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Rpl28P41105 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Rpl28P41105 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC9.41□□□□□ -0.9
Rpl28P41105 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC9.41□□□□□ -0.9
Rpl28P41105 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC9.41□□□□□ -0.9
Rpl28P41105 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC9.41□□□□□ -0.9
Rpl28P41105 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.41□□□□□ -0.9
Rpl28P41105 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Rpl28P41105 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Rpl28P41105 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Rpl28P41105 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Rpl28P41105 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Rpl28P41105 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Rpl28P41105 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Rpl28P41105 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Rpl28P41105 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC9.41□□□□□ -0.9
Rpl28P41105 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Rpl28P41105 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Rpl28P41105 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.41□□□□□ -0.9
Rpl28P41105 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Rpl28P41105 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Rpl28P41105 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Rpl28P41105 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
Rpl28P41105 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Rpl28P41105 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC9.4□□□□□ -0.9
Rpl28P41105 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Rpl28P41105 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Rpl28P41105 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Rpl28P41105 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Rpl28P41105 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Rpl28P41105 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Rpl28P41105 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Rpl28P41105 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Rpl28P41105 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Rpl28P41105 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Rpl28P41105 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Rpl28P41105 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Rpl28P41105 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
Rpl28P41105 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Rpl28P41105 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
Rpl28P41105 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC9.4□□□□□ -0.9
Rpl28P41105 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Rpl28P41105 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Rpl28P41105 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
Rpl28P41105 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC9.4□□□□□ -0.9
Rpl28P41105 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.4□□□□□ -0.9
Rpl28P41105 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC9.4□□□□□ -0.9
Rpl28P41105 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Rpl28P41105 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Rpl28P41105 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC9.4□□□□□ -0.9
Rpl28P41105 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Rpl28P41105 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Rpl28P41105 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Rpl28P41105 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Rpl28P41105 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Rpl28P41105 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Rpl28P41105 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Rpl28P41105 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Rpl28P41105 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC9.4□□□□□ -0.9
Rpl28P41105 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Rpl28P41105 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.4□□□□□ -0.91
Rpl28P41105 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
Rpl28P41105 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
Rpl28P41105 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
Rpl28P41105 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
Rpl28P41105 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
Rpl28P41105 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Rpl28P41105 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Rpl28P41105 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Rpl28P41105 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Rpl28P41105 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Rpl28P41105 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Rpl28P41105 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Rpl28P41105 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Rpl28P41105 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Rpl28P41105 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Rpl28P41105 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Rpl28P41105 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Rpl28P41105 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Rpl28P41105 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
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