Protein–RNA interactions for Protein: P31313

Hoxc11, Homeobox protein Hox-C11, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc11P31313 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxc11P31313 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxc11P31313 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxc11P31313 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxc11P31313 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxc11P31313 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxc11P31313 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxc11P31313 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxc11P31313 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxc11P31313 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxc11P31313 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxc11P31313 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxc11P31313 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxc11P31313 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxc11P31313 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxc11P31313 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxc11P31313 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxc11P31313 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxc11P31313 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxc11P31313 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxc11P31313 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxc11P31313 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxc11P31313 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxc11P31313 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxc11P31313 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxc11P31313 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxc11P31313 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxc11P31313 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxc11P31313 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxc11P31313 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxc11P31313 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxc11P31313 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxc11P31313 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxc11P31313 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxc11P31313 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxc11P31313 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxc11P31313 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxc11P31313 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxc11P31313 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxc11P31313 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxc11P31313 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxc11P31313 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxc11P31313 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxc11P31313 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxc11P31313 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxc11P31313 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxc11P31313 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxc11P31313 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxc11P31313 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxc11P31313 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxc11P31313 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxc11P31313 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxc11P31313 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxc11P31313 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxc11P31313 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxc11P31313 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxc11P31313 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxc11P31313 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxc11P31313 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxc11P31313 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxc11P31313 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxc11P31313 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxc11P31313 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxc11P31313 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxc11P31313 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxc11P31313 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxc11P31313 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxc11P31313 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxc11P31313 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxc11P31313 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxc11P31313 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxc11P31313 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxc11P31313 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxc11P31313 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxc11P31313 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxc11P31313 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxc11P31313 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxc11P31313 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxc11P31313 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxc11P31313 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxc11P31313 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxc11P31313 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxc11P31313 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxc11P31313 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxc11P31313 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxc11P31313 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxc11P31313 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxc11P31313 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxc11P31313 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxc11P31313 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxc11P31313 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxc11P31313 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxc11P31313 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxc11P31313 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxc11P31313 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxc11P31313 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxc11P31313 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxc11P31313 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxc11P31313 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxc11P31313 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
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