Protein–RNA interactions for Protein: P26369

U2af2, Splicing factor U2AF 65 kDa subunit, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2af2P26369 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
U2af2P26369 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
U2af2P26369 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
U2af2P26369 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
U2af2P26369 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
U2af2P26369 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
U2af2P26369 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
U2af2P26369 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
U2af2P26369 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
U2af2P26369 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
U2af2P26369 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
U2af2P26369 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
U2af2P26369 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
U2af2P26369 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
U2af2P26369 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
U2af2P26369 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
U2af2P26369 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
U2af2P26369 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
U2af2P26369 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
U2af2P26369 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
U2af2P26369 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
U2af2P26369 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
U2af2P26369 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
U2af2P26369 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
U2af2P26369 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
U2af2P26369 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
U2af2P26369 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
U2af2P26369 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
U2af2P26369 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
U2af2P26369 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
U2af2P26369 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
U2af2P26369 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
U2af2P26369 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
U2af2P26369 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
U2af2P26369 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
U2af2P26369 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
U2af2P26369 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
U2af2P26369 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
U2af2P26369 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
U2af2P26369 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
U2af2P26369 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
U2af2P26369 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
U2af2P26369 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
U2af2P26369 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
U2af2P26369 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
U2af2P26369 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
U2af2P26369 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
U2af2P26369 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
U2af2P26369 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
U2af2P26369 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
U2af2P26369 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
U2af2P26369 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
U2af2P26369 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
U2af2P26369 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
U2af2P26369 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
U2af2P26369 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
U2af2P26369 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
U2af2P26369 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
U2af2P26369 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
U2af2P26369 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
U2af2P26369 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
U2af2P26369 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
U2af2P26369 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
U2af2P26369 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
U2af2P26369 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
U2af2P26369 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
U2af2P26369 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
U2af2P26369 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
U2af2P26369 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
U2af2P26369 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
U2af2P26369 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
U2af2P26369 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
U2af2P26369 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
U2af2P26369 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
U2af2P26369 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
U2af2P26369 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
U2af2P26369 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
U2af2P26369 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
U2af2P26369 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
U2af2P26369 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
U2af2P26369 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
U2af2P26369 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
U2af2P26369 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
U2af2P26369 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
U2af2P26369 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
U2af2P26369 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
U2af2P26369 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
U2af2P26369 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
U2af2P26369 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
U2af2P26369 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
U2af2P26369 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
U2af2P26369 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
U2af2P26369 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
U2af2P26369 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
U2af2P26369 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
U2af2P26369 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
U2af2P26369 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
U2af2P26369 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
U2af2P26369 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
U2af2P26369 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms