Protein–RNA interactions for Protein: P21995

Emb, Embigin, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EmbP21995 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EmbP21995 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EmbP21995 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EmbP21995 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
EmbP21995 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.05■□□□□ -0
EmbP21995 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EmbP21995 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EmbP21995 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EmbP21995 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EmbP21995 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EmbP21995 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
EmbP21995 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EmbP21995 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EmbP21995 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
EmbP21995 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
EmbP21995 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
EmbP21995 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
EmbP21995 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
EmbP21995 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
EmbP21995 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
EmbP21995 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EmbP21995 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EmbP21995 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
EmbP21995 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EmbP21995 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
EmbP21995 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EmbP21995 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EmbP21995 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EmbP21995 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
EmbP21995 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EmbP21995 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EmbP21995 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EmbP21995 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EmbP21995 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EmbP21995 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
EmbP21995 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
EmbP21995 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
EmbP21995 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.04■□□□□ -0
EmbP21995 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
EmbP21995 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
EmbP21995 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
EmbP21995 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EmbP21995 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EmbP21995 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EmbP21995 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EmbP21995 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EmbP21995 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
EmbP21995 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EmbP21995 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EmbP21995 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EmbP21995 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EmbP21995 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EmbP21995 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
EmbP21995 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EmbP21995 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EmbP21995 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EmbP21995 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EmbP21995 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
EmbP21995 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
EmbP21995 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EmbP21995 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EmbP21995 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EmbP21995 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EmbP21995 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EmbP21995 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EmbP21995 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EmbP21995 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EmbP21995 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
EmbP21995 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EmbP21995 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EmbP21995 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC15.03■□□□□ -0
EmbP21995 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC15.03■□□□□ -0
EmbP21995 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC15.03■□□□□ -0
EmbP21995 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
EmbP21995 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC15.03■□□□□ -0
EmbP21995 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EmbP21995 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EmbP21995 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EmbP21995 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EmbP21995 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EmbP21995 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
EmbP21995 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EmbP21995 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EmbP21995 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
EmbP21995 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC15.03■□□□□ -0
EmbP21995 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
EmbP21995 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
EmbP21995 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
EmbP21995 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EmbP21995 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
EmbP21995 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
EmbP21995 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
EmbP21995 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
EmbP21995 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
EmbP21995 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
EmbP21995 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
EmbP21995 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
EmbP21995 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
EmbP21995 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
EmbP21995 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms