Protein–RNA interactions for Protein: P17918

Pcna, Proliferating cell nuclear antigen, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcnaP17918 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PcnaP17918 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PcnaP17918 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PcnaP17918 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PcnaP17918 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PcnaP17918 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PcnaP17918 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PcnaP17918 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
PcnaP17918 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PcnaP17918 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PcnaP17918 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PcnaP17918 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PcnaP17918 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PcnaP17918 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PcnaP17918 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
PcnaP17918 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PcnaP17918 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PcnaP17918 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
PcnaP17918 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PcnaP17918 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PcnaP17918 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PcnaP17918 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PcnaP17918 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PcnaP17918 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PcnaP17918 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PcnaP17918 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PcnaP17918 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PcnaP17918 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PcnaP17918 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PcnaP17918 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PcnaP17918 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PcnaP17918 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PcnaP17918 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PcnaP17918 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PcnaP17918 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PcnaP17918 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PcnaP17918 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PcnaP17918 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PcnaP17918 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PcnaP17918 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PcnaP17918 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PcnaP17918 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PcnaP17918 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PcnaP17918 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
PcnaP17918 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PcnaP17918 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PcnaP17918 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PcnaP17918 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PcnaP17918 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PcnaP17918 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
PcnaP17918 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PcnaP17918 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PcnaP17918 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PcnaP17918 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PcnaP17918 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PcnaP17918 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PcnaP17918 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PcnaP17918 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PcnaP17918 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PcnaP17918 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PcnaP17918 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PcnaP17918 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PcnaP17918 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PcnaP17918 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PcnaP17918 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
PcnaP17918 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
PcnaP17918 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PcnaP17918 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
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PcnaP17918 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PcnaP17918 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PcnaP17918 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PcnaP17918 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PcnaP17918 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PcnaP17918 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PcnaP17918 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PcnaP17918 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PcnaP17918 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PcnaP17918 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PcnaP17918 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PcnaP17918 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PcnaP17918 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PcnaP17918 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PcnaP17918 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PcnaP17918 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PcnaP17918 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PcnaP17918 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PcnaP17918 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PcnaP17918 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PcnaP17918 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PcnaP17918 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
PcnaP17918 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PcnaP17918 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PcnaP17918 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PcnaP17918 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PcnaP17918 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PcnaP17918 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PcnaP17918 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PcnaP17918 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms