Protein–RNA interactions for Protein: P15975

Usp53, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 53, mousemouse

Predictions only

Length 1,069 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp53P15975 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp53P15975 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp53P15975 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp53P15975 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp53P15975 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp53P15975 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp53P15975 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp53P15975 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp53P15975 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp53P15975 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp53P15975 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp53P15975 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp53P15975 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp53P15975 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp53P15975 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp53P15975 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp53P15975 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp53P15975 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp53P15975 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp53P15975 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp53P15975 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp53P15975 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp53P15975 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp53P15975 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp53P15975 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp53P15975 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp53P15975 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp53P15975 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp53P15975 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp53P15975 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp53P15975 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp53P15975 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp53P15975 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp53P15975 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp53P15975 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp53P15975 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp53P15975 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp53P15975 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp53P15975 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp53P15975 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp53P15975 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp53P15975 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp53P15975 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp53P15975 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp53P15975 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp53P15975 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp53P15975 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Usp53P15975 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp53P15975 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp53P15975 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp53P15975 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp53P15975 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp53P15975 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp53P15975 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp53P15975 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp53P15975 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp53P15975 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp53P15975 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp53P15975 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp53P15975 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp53P15975 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp53P15975 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp53P15975 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp53P15975 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp53P15975 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp53P15975 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp53P15975 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp53P15975 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp53P15975 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp53P15975 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp53P15975 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp53P15975 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp53P15975 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp53P15975 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp53P15975 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp53P15975 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp53P15975 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp53P15975 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp53P15975 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp53P15975 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp53P15975 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp53P15975 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp53P15975 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp53P15975 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp53P15975 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp53P15975 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp53P15975 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp53P15975 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp53P15975 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp53P15975 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp53P15975 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp53P15975 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp53P15975 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp53P15975 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp53P15975 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp53P15975 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp53P15975 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp53P15975 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp53P15975 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp53P15975 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms