Protein–RNA interactions for Protein: P11438

Lamp1, Lysosome-associated membrane glycoprotein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamp1P11438 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Lamp1P11438 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lamp1P11438 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lamp1P11438 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lamp1P11438 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lamp1P11438 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lamp1P11438 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lamp1P11438 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lamp1P11438 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lamp1P11438 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lamp1P11438 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lamp1P11438 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lamp1P11438 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lamp1P11438 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lamp1P11438 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lamp1P11438 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lamp1P11438 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lamp1P11438 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lamp1P11438 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lamp1P11438 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lamp1P11438 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lamp1P11438 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lamp1P11438 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lamp1P11438 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lamp1P11438 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lamp1P11438 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lamp1P11438 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lamp1P11438 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Lamp1P11438 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Lamp1P11438 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Lamp1P11438 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Lamp1P11438 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lamp1P11438 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lamp1P11438 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Lamp1P11438 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lamp1P11438 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lamp1P11438 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lamp1P11438 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lamp1P11438 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lamp1P11438 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lamp1P11438 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lamp1P11438 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lamp1P11438 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lamp1P11438 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lamp1P11438 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lamp1P11438 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lamp1P11438 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lamp1P11438 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lamp1P11438 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lamp1P11438 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Lamp1P11438 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Lamp1P11438 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Lamp1P11438 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Lamp1P11438 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Lamp1P11438 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Lamp1P11438 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Lamp1P11438 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Lamp1P11438 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Lamp1P11438 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Lamp1P11438 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lamp1P11438 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lamp1P11438 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Lamp1P11438 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lamp1P11438 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lamp1P11438 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lamp1P11438 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lamp1P11438 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lamp1P11438 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lamp1P11438 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lamp1P11438 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lamp1P11438 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lamp1P11438 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lamp1P11438 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lamp1P11438 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lamp1P11438 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lamp1P11438 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Lamp1P11438 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lamp1P11438 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lamp1P11438 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lamp1P11438 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lamp1P11438 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lamp1P11438 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Lamp1P11438 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lamp1P11438 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lamp1P11438 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lamp1P11438 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lamp1P11438 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lamp1P11438 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lamp1P11438 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Lamp1P11438 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Lamp1P11438 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lamp1P11438 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Lamp1P11438 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lamp1P11438 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lamp1P11438 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lamp1P11438 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lamp1P11438 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lamp1P11438 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lamp1P11438 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lamp1P11438 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms