Protein–RNA interactions for Protein: P10404

MLV-related proviral Env polyprotein, mousemouse

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Length 641 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P10404 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
P10404 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
P10404 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
P10404 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
P10404 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
P10404 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
P10404 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
P10404 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
P10404 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
P10404 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
P10404 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
P10404 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
P10404 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
P10404 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
P10404 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
P10404 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
P10404 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
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P10404 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
P10404 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
P10404 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
P10404 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
P10404 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
P10404 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
P10404 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
P10404 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
P10404 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
P10404 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
P10404 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
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P10404 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
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P10404 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
P10404 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
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P10404 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
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P10404 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
P10404 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
P10404 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
P10404 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
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P10404 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
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P10404 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
P10404 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
P10404 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
P10404 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
P10404 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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P10404 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
P10404 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
P10404 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
P10404 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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P10404 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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