Protein–RNA interactions for Protein: P0DN34

Ndufb1, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 57 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufb1P0DN34 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Ndufb1P0DN34 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Ndufb1P0DN34 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Ndufb1P0DN34 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
Ndufb1P0DN34 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Ndufb1P0DN34 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Ndufb1P0DN34 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Ndufb1P0DN34 Phf24-203ENSMUST00000107976 6538 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Ndufb1P0DN34 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Ndufb1P0DN34 Npas2-201ENSMUST00000056815 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Ndufb1P0DN34 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Ndufb1P0DN34 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Ndufb1P0DN34 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Ndufb1P0DN34 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Ndufb1P0DN34 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Ndufb1P0DN34 Zzef1-201ENSMUST00000069395 11150 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Ndufb1P0DN34 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Ndufb1P0DN34 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Ndufb1P0DN34 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Ndufb1P0DN34 Nod1-201ENSMUST00000060655 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Ndufb1P0DN34 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Ndufb1P0DN34 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Ndufb1P0DN34 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Ndufb1P0DN34 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Ndufb1P0DN34 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Ndufb1P0DN34 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Ndufb1P0DN34 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Ndufb1P0DN34 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Ndufb1P0DN34 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Ndufb1P0DN34 Tardbp-202ENSMUST00000084125 7477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Ndufb1P0DN34 Plec-217ENSMUST00000169438 14827 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Ndufb1P0DN34 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Ndufb1P0DN34 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Ndufb1P0DN34 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Ndufb1P0DN34 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Ndufb1P0DN34 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Ndufb1P0DN34 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Ndufb1P0DN34 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Ndufb1P0DN34 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Ndufb1P0DN34 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Ndufb1P0DN34 Styx-205ENSMUST00000226873 12974 ntAPPRIS P1 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Ndufb1P0DN34 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Ndufb1P0DN34 Mcc-201ENSMUST00000089874 7858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Ndufb1P0DN34 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Ndufb1P0DN34 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Ndufb1P0DN34 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Ndufb1P0DN34 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Ndufb1P0DN34 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Ndufb1P0DN34 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Ndufb1P0DN34 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Ndufb1P0DN34 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Ndufb1P0DN34 Taf3-204ENSMUST00000114909 4897 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Ndufb1P0DN34 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Ndufb1P0DN34 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Ndufb1P0DN34 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Ndufb1P0DN34 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Ndufb1P0DN34 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Ndufb1P0DN34 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Ndufb1P0DN34 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Ndufb1P0DN34 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Ndufb1P0DN34 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Ndufb1P0DN34 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Ndufb1P0DN34 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Ndufb1P0DN34 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Ndufb1P0DN34 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Ndufb1P0DN34 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Ndufb1P0DN34 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Ndufb1P0DN34 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Ndufb1P0DN34 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Ndufb1P0DN34 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Ndufb1P0DN34 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Ndufb1P0DN34 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Ndufb1P0DN34 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Ndufb1P0DN34 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Ndufb1P0DN34 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Ndufb1P0DN34 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Ndufb1P0DN34 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Ndufb1P0DN34 Nlgn3-201ENSMUST00000065858 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Ndufb1P0DN34 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Ndufb1P0DN34 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Ndufb1P0DN34 Cdkl5-205ENSMUST00000198931 9796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Ndufb1P0DN34 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Ndufb1P0DN34 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Ndufb1P0DN34 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Ndufb1P0DN34 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Ndufb1P0DN34 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Ndufb1P0DN34 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Ndufb1P0DN34 Plec-206ENSMUST00000074834 14855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Ndufb1P0DN34 Disp1-201ENSMUST00000003035 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Ndufb1P0DN34 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Ndufb1P0DN34 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Ndufb1P0DN34 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Ndufb1P0DN34 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Ndufb1P0DN34 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Ndufb1P0DN34 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Ndufb1P0DN34 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Ndufb1P0DN34 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Ndufb1P0DN34 Kif1b-203ENSMUST00000060537 10233 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Ndufb1P0DN34 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Ndufb1P0DN34 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms