Protein–RNA interactions for Protein: P08032

Spta1, Spectrin alpha chain, erythrocytic 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spta1P08032 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Spta1P08032 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Spta1P08032 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Spta1P08032 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Spta1P08032 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Spta1P08032 Gm29787-201ENSMUST00000222129 849 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Spta1P08032 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Spta1P08032 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Spta1P08032 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Spta1P08032 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Spta1P08032 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Spta1P08032 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Spta1P08032 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Spta1P08032 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Spta1P08032 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Spta1P08032 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Spta1P08032 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Spta1P08032 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Spta1P08032 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Spta1P08032 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Spta1P08032 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Spta1P08032 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Spta1P08032 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Spta1P08032 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Spta1P08032 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Spta1P08032 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Spta1P08032 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Spta1P08032 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Spta1P08032 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Spta1P08032 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Spta1P08032 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Spta1P08032 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Spta1P08032 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Spta1P08032 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Spta1P08032 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Spta1P08032 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Spta1P08032 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Spta1P08032 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Spta1P08032 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Spta1P08032 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Spta1P08032 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Spta1P08032 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Spta1P08032 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Spta1P08032 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Spta1P08032 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Spta1P08032 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Spta1P08032 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Spta1P08032 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Spta1P08032 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Spta1P08032 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Spta1P08032 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Spta1P08032 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Spta1P08032 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Spta1P08032 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Spta1P08032 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Spta1P08032 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Spta1P08032 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Spta1P08032 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Spta1P08032 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Spta1P08032 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Spta1P08032 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Spta1P08032 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Spta1P08032 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Spta1P08032 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Spta1P08032 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Spta1P08032 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Spta1P08032 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Spta1P08032 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Spta1P08032 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Spta1P08032 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Spta1P08032 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Spta1P08032 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Spta1P08032 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Spta1P08032 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Spta1P08032 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Spta1P08032 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Spta1P08032 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Spta1P08032 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Spta1P08032 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Spta1P08032 Gm37986-201ENSMUST00000193285 383 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Spta1P08032 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Spta1P08032 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Spta1P08032 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Spta1P08032 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Spta1P08032 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
Spta1P08032 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Spta1P08032 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Spta1P08032 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Spta1P08032 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Spta1P08032 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Spta1P08032 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Spta1P08032 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Spta1P08032 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Spta1P08032 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Spta1P08032 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Spta1P08032 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Spta1P08032 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Spta1P08032 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Spta1P08032 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Spta1P08032 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms