Protein–RNA interactions for Protein: O88700

Blm, Bloom syndrome protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BlmO88700 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BlmO88700 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BlmO88700 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC21.31■■□□□ 1
BlmO88700 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BlmO88700 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BlmO88700 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BlmO88700 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BlmO88700 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BlmO88700 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
BlmO88700 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BlmO88700 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BlmO88700 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
BlmO88700 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
BlmO88700 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
BlmO88700 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BlmO88700 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
BlmO88700 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC21.3■■□□□ 1
BlmO88700 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
BlmO88700 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
BlmO88700 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
BlmO88700 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BlmO88700 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BlmO88700 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BlmO88700 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BlmO88700 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
BlmO88700 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BlmO88700 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BlmO88700 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BlmO88700 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BlmO88700 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BlmO88700 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
BlmO88700 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BlmO88700 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BlmO88700 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BlmO88700 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BlmO88700 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BlmO88700 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
BlmO88700 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BlmO88700 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BlmO88700 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
BlmO88700 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
BlmO88700 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
BlmO88700 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BlmO88700 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC21.29■■□□□ 1
BlmO88700 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
BlmO88700 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BlmO88700 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BlmO88700 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BlmO88700 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC21.29■■□□□ 1
BlmO88700 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BlmO88700 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC21.29■■□□□ 1
BlmO88700 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.29■■□□□ 1
BlmO88700 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BlmO88700 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BlmO88700 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BlmO88700 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
BlmO88700 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
BlmO88700 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BlmO88700 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
BlmO88700 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
BlmO88700 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BlmO88700 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC21.29■■□□□ 1
BlmO88700 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC21.29■■□□□ 1
BlmO88700 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BlmO88700 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC21.29■■□□□ 1
BlmO88700 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
BlmO88700 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
BlmO88700 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BlmO88700 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
BlmO88700 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BlmO88700 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BlmO88700 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BlmO88700 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BlmO88700 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
BlmO88700 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
BlmO88700 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
BlmO88700 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
BlmO88700 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BlmO88700 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BlmO88700 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BlmO88700 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC21.28■■□□□ 1
BlmO88700 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BlmO88700 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
BlmO88700 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BlmO88700 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BlmO88700 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BlmO88700 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BlmO88700 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
BlmO88700 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BlmO88700 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BlmO88700 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC21.28■■□□□ 1
BlmO88700 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
BlmO88700 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC21.28■■□□□ 1
BlmO88700 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BlmO88700 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
BlmO88700 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC21.28■■□□□ 1
BlmO88700 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC21.28■■□□□ 1
BlmO88700 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BlmO88700 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC21.28■■□□□ 1
BlmO88700 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms