Protein–RNA interactions for Protein: O55187

Cbx4, E3 SUMO-protein ligase CBX4, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx4O55187 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cbx4O55187 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cbx4O55187 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cbx4O55187 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cbx4O55187 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cbx4O55187 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cbx4O55187 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Cbx4O55187 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cbx4O55187 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cbx4O55187 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Cbx4O55187 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Cbx4O55187 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cbx4O55187 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cbx4O55187 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cbx4O55187 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cbx4O55187 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cbx4O55187 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cbx4O55187 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cbx4O55187 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cbx4O55187 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cbx4O55187 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cbx4O55187 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cbx4O55187 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cbx4O55187 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cbx4O55187 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cbx4O55187 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cbx4O55187 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cbx4O55187 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cbx4O55187 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cbx4O55187 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cbx4O55187 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cbx4O55187 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cbx4O55187 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cbx4O55187 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Cbx4O55187 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cbx4O55187 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cbx4O55187 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cbx4O55187 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cbx4O55187 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Cbx4O55187 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cbx4O55187 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cbx4O55187 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Cbx4O55187 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cbx4O55187 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cbx4O55187 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cbx4O55187 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cbx4O55187 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cbx4O55187 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cbx4O55187 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cbx4O55187 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Cbx4O55187 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Cbx4O55187 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Cbx4O55187 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Cbx4O55187 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Cbx4O55187 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
Cbx4O55187 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Cbx4O55187 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Cbx4O55187 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Cbx4O55187 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cbx4O55187 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cbx4O55187 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cbx4O55187 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Cbx4O55187 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cbx4O55187 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cbx4O55187 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cbx4O55187 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cbx4O55187 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cbx4O55187 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cbx4O55187 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cbx4O55187 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cbx4O55187 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cbx4O55187 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Cbx4O55187 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cbx4O55187 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cbx4O55187 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Cbx4O55187 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Cbx4O55187 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Cbx4O55187 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Cbx4O55187 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cbx4O55187 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cbx4O55187 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cbx4O55187 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cbx4O55187 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cbx4O55187 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cbx4O55187 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cbx4O55187 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cbx4O55187 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cbx4O55187 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cbx4O55187 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cbx4O55187 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cbx4O55187 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cbx4O55187 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cbx4O55187 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cbx4O55187 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cbx4O55187 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cbx4O55187 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cbx4O55187 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cbx4O55187 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cbx4O55187 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cbx4O55187 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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