Protein–RNA interactions for Protein: O54967

Tnk2, Activated CDC42 kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,055 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnk2O54967 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnk2O54967 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnk2O54967 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnk2O54967 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnk2O54967 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnk2O54967 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnk2O54967 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnk2O54967 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnk2O54967 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnk2O54967 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnk2O54967 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnk2O54967 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnk2O54967 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnk2O54967 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnk2O54967 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnk2O54967 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnk2O54967 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnk2O54967 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnk2O54967 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnk2O54967 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnk2O54967 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnk2O54967 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnk2O54967 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnk2O54967 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnk2O54967 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnk2O54967 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnk2O54967 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnk2O54967 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnk2O54967 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnk2O54967 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnk2O54967 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnk2O54967 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnk2O54967 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnk2O54967 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnk2O54967 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnk2O54967 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnk2O54967 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnk2O54967 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnk2O54967 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnk2O54967 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnk2O54967 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnk2O54967 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnk2O54967 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnk2O54967 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnk2O54967 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnk2O54967 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnk2O54967 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnk2O54967 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnk2O54967 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnk2O54967 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnk2O54967 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnk2O54967 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnk2O54967 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnk2O54967 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnk2O54967 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnk2O54967 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnk2O54967 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnk2O54967 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnk2O54967 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnk2O54967 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnk2O54967 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnk2O54967 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnk2O54967 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnk2O54967 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Tnk2O54967 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Tnk2O54967 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Tnk2O54967 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Tnk2O54967 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tnk2O54967 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tnk2O54967 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tnk2O54967 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Tnk2O54967 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tnk2O54967 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tnk2O54967 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Tnk2O54967 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Tnk2O54967 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tnk2O54967 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tnk2O54967 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Tnk2O54967 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tnk2O54967 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tnk2O54967 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tnk2O54967 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tnk2O54967 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tnk2O54967 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tnk2O54967 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tnk2O54967 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tnk2O54967 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tnk2O54967 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tnk2O54967 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tnk2O54967 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tnk2O54967 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tnk2O54967 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tnk2O54967 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tnk2O54967 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tnk2O54967 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tnk2O54967 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tnk2O54967 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tnk2O54967 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tnk2O54967 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tnk2O54967 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65 ms