Protein–RNA interactions for Protein: O35185

Bhlhe40, Class E basic helix-loop-helix protein 40, mousemouse

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Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe40O35185 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Bhlhe40O35185 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Bhlhe40O35185 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Bhlhe40O35185 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Bhlhe40O35185 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Bhlhe40O35185 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Bhlhe40O35185 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Bhlhe40O35185 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Bhlhe40O35185 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Bhlhe40O35185 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Bhlhe40O35185 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Bhlhe40O35185 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Bhlhe40O35185 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Bhlhe40O35185 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Bhlhe40O35185 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Bhlhe40O35185 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Bhlhe40O35185 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Bhlhe40O35185 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Bhlhe40O35185 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Bhlhe40O35185 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Bhlhe40O35185 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Bhlhe40O35185 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Bhlhe40O35185 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Bhlhe40O35185 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Bhlhe40O35185 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Bhlhe40O35185 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Bhlhe40O35185 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Bhlhe40O35185 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Bhlhe40O35185 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Bhlhe40O35185 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Bhlhe40O35185 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Bhlhe40O35185 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Bhlhe40O35185 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Bhlhe40O35185 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Bhlhe40O35185 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Bhlhe40O35185 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Bhlhe40O35185 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Bhlhe40O35185 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Bhlhe40O35185 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Bhlhe40O35185 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Bhlhe40O35185 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Bhlhe40O35185 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Bhlhe40O35185 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Bhlhe40O35185 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Bhlhe40O35185 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Bhlhe40O35185 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Bhlhe40O35185 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Bhlhe40O35185 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Bhlhe40O35185 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Bhlhe40O35185 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Bhlhe40O35185 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Bhlhe40O35185 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Bhlhe40O35185 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Bhlhe40O35185 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Bhlhe40O35185 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Bhlhe40O35185 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Bhlhe40O35185 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Bhlhe40O35185 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Bhlhe40O35185 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Bhlhe40O35185 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Bhlhe40O35185 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Bhlhe40O35185 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Bhlhe40O35185 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Bhlhe40O35185 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Bhlhe40O35185 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Bhlhe40O35185 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Bhlhe40O35185 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Bhlhe40O35185 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Bhlhe40O35185 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Bhlhe40O35185 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Bhlhe40O35185 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Bhlhe40O35185 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Bhlhe40O35185 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Bhlhe40O35185 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Bhlhe40O35185 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Bhlhe40O35185 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Bhlhe40O35185 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Bhlhe40O35185 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Bhlhe40O35185 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Bhlhe40O35185 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Bhlhe40O35185 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Bhlhe40O35185 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Bhlhe40O35185 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Bhlhe40O35185 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Bhlhe40O35185 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Bhlhe40O35185 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Bhlhe40O35185 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Bhlhe40O35185 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Bhlhe40O35185 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Bhlhe40O35185 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Bhlhe40O35185 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Bhlhe40O35185 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Bhlhe40O35185 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Bhlhe40O35185 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Bhlhe40O35185 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Bhlhe40O35185 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Bhlhe40O35185 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Bhlhe40O35185 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Bhlhe40O35185 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Bhlhe40O35185 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
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