Protein–RNA interactions for Protein: O08917

Flot1, Flotillin-1, mousemouse

Predictions only

Length 428 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Flot1O08917 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Flot1O08917 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Flot1O08917 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Flot1O08917 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Flot1O08917 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Flot1O08917 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Flot1O08917 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Flot1O08917 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Flot1O08917 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Flot1O08917 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Flot1O08917 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Flot1O08917 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Flot1O08917 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Flot1O08917 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Flot1O08917 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Flot1O08917 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Flot1O08917 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Flot1O08917 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Flot1O08917 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Flot1O08917 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Flot1O08917 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Flot1O08917 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Flot1O08917 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Flot1O08917 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Flot1O08917 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Flot1O08917 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Flot1O08917 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Flot1O08917 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Flot1O08917 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Flot1O08917 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Flot1O08917 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Flot1O08917 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Flot1O08917 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Flot1O08917 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Flot1O08917 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Flot1O08917 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Flot1O08917 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Flot1O08917 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Flot1O08917 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Flot1O08917 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Flot1O08917 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Flot1O08917 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Flot1O08917 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Flot1O08917 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Flot1O08917 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Flot1O08917 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Flot1O08917 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Flot1O08917 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Flot1O08917 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Flot1O08917 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Flot1O08917 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Flot1O08917 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Flot1O08917 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Flot1O08917 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Flot1O08917 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Flot1O08917 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Flot1O08917 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Flot1O08917 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Flot1O08917 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Flot1O08917 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Flot1O08917 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Flot1O08917 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Flot1O08917 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Flot1O08917 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Flot1O08917 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Flot1O08917 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Flot1O08917 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Flot1O08917 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Flot1O08917 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Flot1O08917 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Flot1O08917 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Flot1O08917 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Flot1O08917 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Flot1O08917 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Flot1O08917 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Flot1O08917 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Flot1O08917 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Flot1O08917 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Flot1O08917 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Flot1O08917 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Flot1O08917 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Flot1O08917 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Flot1O08917 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Flot1O08917 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Flot1O08917 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Flot1O08917 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Flot1O08917 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Flot1O08917 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Flot1O08917 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Flot1O08917 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Flot1O08917 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Flot1O08917 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Flot1O08917 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Flot1O08917 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms