Protein–RNA interactions for Protein: M0QWN7

Usp35, Ubiquitin-specific peptidase 35, mousemouse

Predictions only

Length 1,009 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp35M0QWN7 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Usp35M0QWN7 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp35M0QWN7 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp35M0QWN7 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp35M0QWN7 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Usp35M0QWN7 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Usp35M0QWN7 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Usp35M0QWN7 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Usp35M0QWN7 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Usp35M0QWN7 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Usp35M0QWN7 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usp35M0QWN7 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Usp35M0QWN7 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Usp35M0QWN7 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usp35M0QWN7 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Usp35M0QWN7 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Usp35M0QWN7 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Usp35M0QWN7 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Usp35M0QWN7 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usp35M0QWN7 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usp35M0QWN7 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usp35M0QWN7 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usp35M0QWN7 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usp35M0QWN7 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usp35M0QWN7 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usp35M0QWN7 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usp35M0QWN7 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Usp35M0QWN7 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usp35M0QWN7 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usp35M0QWN7 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usp35M0QWN7 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usp35M0QWN7 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usp35M0QWN7 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usp35M0QWN7 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usp35M0QWN7 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usp35M0QWN7 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usp35M0QWN7 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Usp35M0QWN7 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp35M0QWN7 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp35M0QWN7 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp35M0QWN7 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp35M0QWN7 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Usp35M0QWN7 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp35M0QWN7 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp35M0QWN7 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Usp35M0QWN7 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Usp35M0QWN7 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Usp35M0QWN7 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp35M0QWN7 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp35M0QWN7 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp35M0QWN7 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp35M0QWN7 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp35M0QWN7 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Usp35M0QWN7 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp35M0QWN7 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Usp35M0QWN7 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp35M0QWN7 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Usp35M0QWN7 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp35M0QWN7 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Usp35M0QWN7 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp35M0QWN7 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Usp35M0QWN7 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp35M0QWN7 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp35M0QWN7 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Usp35M0QWN7 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp35M0QWN7 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp35M0QWN7 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp35M0QWN7 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp35M0QWN7 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.03■□□□□ -0
Usp35M0QWN7 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp35M0QWN7 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp35M0QWN7 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp35M0QWN7 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Usp35M0QWN7 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp35M0QWN7 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Usp35M0QWN7 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp35M0QWN7 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Usp35M0QWN7 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp35M0QWN7 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Usp35M0QWN7 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Usp35M0QWN7 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Usp35M0QWN7 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Usp35M0QWN7 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp35M0QWN7 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp35M0QWN7 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Usp35M0QWN7 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp35M0QWN7 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Usp35M0QWN7 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp35M0QWN7 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp35M0QWN7 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp35M0QWN7 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Usp35M0QWN7 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Usp35M0QWN7 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp35M0QWN7 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp35M0QWN7 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Usp35M0QWN7 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Usp35M0QWN7 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp35M0QWN7 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp35M0QWN7 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp35M0QWN7 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms