Protein–RNA interactions for Protein: J3QMY9

Top6bl, Type 2 DNA topoisomerase 6 subunit B-like, mousemouse

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Length 579 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Top6blJ3QMY9 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Top6blJ3QMY9 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Top6blJ3QMY9 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Top6blJ3QMY9 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Top6blJ3QMY9 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Top6blJ3QMY9 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Top6blJ3QMY9 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Top6blJ3QMY9 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Top6blJ3QMY9 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Top6blJ3QMY9 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Top6blJ3QMY9 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Top6blJ3QMY9 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Top6blJ3QMY9 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Top6blJ3QMY9 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Top6blJ3QMY9 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Top6blJ3QMY9 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Top6blJ3QMY9 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Top6blJ3QMY9 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Top6blJ3QMY9 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Top6blJ3QMY9 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Top6blJ3QMY9 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Top6blJ3QMY9 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Top6blJ3QMY9 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Top6blJ3QMY9 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Top6blJ3QMY9 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Top6blJ3QMY9 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Top6blJ3QMY9 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Top6blJ3QMY9 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Top6blJ3QMY9 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Top6blJ3QMY9 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Top6blJ3QMY9 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Top6blJ3QMY9 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Top6blJ3QMY9 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Top6blJ3QMY9 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Top6blJ3QMY9 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Top6blJ3QMY9 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Top6blJ3QMY9 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Top6blJ3QMY9 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Top6blJ3QMY9 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Top6blJ3QMY9 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Top6blJ3QMY9 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Top6blJ3QMY9 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Top6blJ3QMY9 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Top6blJ3QMY9 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Top6blJ3QMY9 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Top6blJ3QMY9 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Top6blJ3QMY9 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Top6blJ3QMY9 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Top6blJ3QMY9 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Top6blJ3QMY9 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Top6blJ3QMY9 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Top6blJ3QMY9 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Top6blJ3QMY9 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Top6blJ3QMY9 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Top6blJ3QMY9 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Top6blJ3QMY9 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Top6blJ3QMY9 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Top6blJ3QMY9 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Top6blJ3QMY9 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Top6blJ3QMY9 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Top6blJ3QMY9 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Top6blJ3QMY9 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Top6blJ3QMY9 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Top6blJ3QMY9 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Top6blJ3QMY9 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Top6blJ3QMY9 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Top6blJ3QMY9 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Top6blJ3QMY9 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Top6blJ3QMY9 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Top6blJ3QMY9 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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