Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1M1

Pdzd2, PDZ domain-containing 2, mousemouse

Predictions only

Length 2,796 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd2E9Q1M1 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pdzd2E9Q1M1 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Pdzd2E9Q1M1 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pdzd2E9Q1M1 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pdzd2E9Q1M1 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Pdzd2E9Q1M1 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pdzd2E9Q1M1 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Pdzd2E9Q1M1 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Pdzd2E9Q1M1 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Pdzd2E9Q1M1 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Pdzd2E9Q1M1 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pdzd2E9Q1M1 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pdzd2E9Q1M1 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pdzd2E9Q1M1 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pdzd2E9Q1M1 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Pdzd2E9Q1M1 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Pdzd2E9Q1M1 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Pdzd2E9Q1M1 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Pdzd2E9Q1M1 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Pdzd2E9Q1M1 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Pdzd2E9Q1M1 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pdzd2E9Q1M1 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pdzd2E9Q1M1 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pdzd2E9Q1M1 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pdzd2E9Q1M1 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pdzd2E9Q1M1 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pdzd2E9Q1M1 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pdzd2E9Q1M1 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pdzd2E9Q1M1 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pdzd2E9Q1M1 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pdzd2E9Q1M1 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pdzd2E9Q1M1 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pdzd2E9Q1M1 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pdzd2E9Q1M1 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pdzd2E9Q1M1 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pdzd2E9Q1M1 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pdzd2E9Q1M1 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Pdzd2E9Q1M1 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Pdzd2E9Q1M1 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pdzd2E9Q1M1 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Pdzd2E9Q1M1 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pdzd2E9Q1M1 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pdzd2E9Q1M1 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Pdzd2E9Q1M1 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pdzd2E9Q1M1 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Pdzd2E9Q1M1 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pdzd2E9Q1M1 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pdzd2E9Q1M1 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pdzd2E9Q1M1 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pdzd2E9Q1M1 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pdzd2E9Q1M1 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pdzd2E9Q1M1 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pdzd2E9Q1M1 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pdzd2E9Q1M1 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pdzd2E9Q1M1 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pdzd2E9Q1M1 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pdzd2E9Q1M1 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pdzd2E9Q1M1 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pdzd2E9Q1M1 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pdzd2E9Q1M1 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pdzd2E9Q1M1 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pdzd2E9Q1M1 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Pdzd2E9Q1M1 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Pdzd2E9Q1M1 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pdzd2E9Q1M1 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pdzd2E9Q1M1 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Pdzd2E9Q1M1 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Pdzd2E9Q1M1 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pdzd2E9Q1M1 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pdzd2E9Q1M1 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pdzd2E9Q1M1 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pdzd2E9Q1M1 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pdzd2E9Q1M1 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Pdzd2E9Q1M1 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pdzd2E9Q1M1 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pdzd2E9Q1M1 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pdzd2E9Q1M1 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pdzd2E9Q1M1 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pdzd2E9Q1M1 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pdzd2E9Q1M1 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pdzd2E9Q1M1 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Pdzd2E9Q1M1 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Pdzd2E9Q1M1 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pdzd2E9Q1M1 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pdzd2E9Q1M1 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pdzd2E9Q1M1 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Pdzd2E9Q1M1 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pdzd2E9Q1M1 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pdzd2E9Q1M1 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pdzd2E9Q1M1 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pdzd2E9Q1M1 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pdzd2E9Q1M1 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pdzd2E9Q1M1 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Pdzd2E9Q1M1 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pdzd2E9Q1M1 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pdzd2E9Q1M1 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pdzd2E9Q1M1 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pdzd2E9Q1M1 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pdzd2E9Q1M1 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pdzd2E9Q1M1 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
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