Protein–RNA interactions for Protein: E9PWG2

Trappc8, Trafficking protein particle complex 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc8E9PWG2 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trappc8E9PWG2 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trappc8E9PWG2 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trappc8E9PWG2 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trappc8E9PWG2 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Trappc8E9PWG2 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trappc8E9PWG2 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trappc8E9PWG2 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trappc8E9PWG2 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trappc8E9PWG2 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trappc8E9PWG2 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trappc8E9PWG2 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trappc8E9PWG2 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trappc8E9PWG2 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trappc8E9PWG2 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trappc8E9PWG2 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trappc8E9PWG2 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Trappc8E9PWG2 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trappc8E9PWG2 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Trappc8E9PWG2 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trappc8E9PWG2 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Trappc8E9PWG2 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trappc8E9PWG2 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Trappc8E9PWG2 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trappc8E9PWG2 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trappc8E9PWG2 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trappc8E9PWG2 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trappc8E9PWG2 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trappc8E9PWG2 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trappc8E9PWG2 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trappc8E9PWG2 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trappc8E9PWG2 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trappc8E9PWG2 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trappc8E9PWG2 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trappc8E9PWG2 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trappc8E9PWG2 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Trappc8E9PWG2 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trappc8E9PWG2 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trappc8E9PWG2 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trappc8E9PWG2 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trappc8E9PWG2 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Trappc8E9PWG2 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Trappc8E9PWG2 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Trappc8E9PWG2 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Trappc8E9PWG2 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trappc8E9PWG2 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trappc8E9PWG2 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trappc8E9PWG2 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trappc8E9PWG2 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trappc8E9PWG2 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trappc8E9PWG2 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trappc8E9PWG2 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trappc8E9PWG2 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trappc8E9PWG2 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Trappc8E9PWG2 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Trappc8E9PWG2 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Trappc8E9PWG2 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Trappc8E9PWG2 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Trappc8E9PWG2 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Trappc8E9PWG2 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Trappc8E9PWG2 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Trappc8E9PWG2 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Trappc8E9PWG2 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Trappc8E9PWG2 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Trappc8E9PWG2 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Trappc8E9PWG2 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Trappc8E9PWG2 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Trappc8E9PWG2 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Trappc8E9PWG2 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Trappc8E9PWG2 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Trappc8E9PWG2 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trappc8E9PWG2 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trappc8E9PWG2 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trappc8E9PWG2 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Trappc8E9PWG2 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trappc8E9PWG2 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trappc8E9PWG2 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trappc8E9PWG2 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trappc8E9PWG2 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trappc8E9PWG2 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trappc8E9PWG2 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trappc8E9PWG2 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trappc8E9PWG2 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Trappc8E9PWG2 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Trappc8E9PWG2 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Trappc8E9PWG2 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trappc8E9PWG2 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trappc8E9PWG2 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trappc8E9PWG2 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trappc8E9PWG2 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trappc8E9PWG2 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trappc8E9PWG2 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trappc8E9PWG2 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trappc8E9PWG2 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trappc8E9PWG2 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trappc8E9PWG2 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trappc8E9PWG2 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trappc8E9PWG2 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trappc8E9PWG2 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trappc8E9PWG2 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms