Protein–RNA interactions for Protein: E9PUP1

Syde2, Synapse defective 1, Rho GTPase, homolog 2 (C. elegans), mousemouse

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde2E9PUP1 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Syde2E9PUP1 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Syde2E9PUP1 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Syde2E9PUP1 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Syde2E9PUP1 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Syde2E9PUP1 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Syde2E9PUP1 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Syde2E9PUP1 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Syde2E9PUP1 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Syde2E9PUP1 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Syde2E9PUP1 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Syde2E9PUP1 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Syde2E9PUP1 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Syde2E9PUP1 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Syde2E9PUP1 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Syde2E9PUP1 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Syde2E9PUP1 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Syde2E9PUP1 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Syde2E9PUP1 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Syde2E9PUP1 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Syde2E9PUP1 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Syde2E9PUP1 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Syde2E9PUP1 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Syde2E9PUP1 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Syde2E9PUP1 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Syde2E9PUP1 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Syde2E9PUP1 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Syde2E9PUP1 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Syde2E9PUP1 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Syde2E9PUP1 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Syde2E9PUP1 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Syde2E9PUP1 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Syde2E9PUP1 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Syde2E9PUP1 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Syde2E9PUP1 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Syde2E9PUP1 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Syde2E9PUP1 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Syde2E9PUP1 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Syde2E9PUP1 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Syde2E9PUP1 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Syde2E9PUP1 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Syde2E9PUP1 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Syde2E9PUP1 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Syde2E9PUP1 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Syde2E9PUP1 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Syde2E9PUP1 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Syde2E9PUP1 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Syde2E9PUP1 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Syde2E9PUP1 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Syde2E9PUP1 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Syde2E9PUP1 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Syde2E9PUP1 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Syde2E9PUP1 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Syde2E9PUP1 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Syde2E9PUP1 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Syde2E9PUP1 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Syde2E9PUP1 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Syde2E9PUP1 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Syde2E9PUP1 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Syde2E9PUP1 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Syde2E9PUP1 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Syde2E9PUP1 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Syde2E9PUP1 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Syde2E9PUP1 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Syde2E9PUP1 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Syde2E9PUP1 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Syde2E9PUP1 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Syde2E9PUP1 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Syde2E9PUP1 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Syde2E9PUP1 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Syde2E9PUP1 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Syde2E9PUP1 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Syde2E9PUP1 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Syde2E9PUP1 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Syde2E9PUP1 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Syde2E9PUP1 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Syde2E9PUP1 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Syde2E9PUP1 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Syde2E9PUP1 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Syde2E9PUP1 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Syde2E9PUP1 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Syde2E9PUP1 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Syde2E9PUP1 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Syde2E9PUP1 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Syde2E9PUP1 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Syde2E9PUP1 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Syde2E9PUP1 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Syde2E9PUP1 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Syde2E9PUP1 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Syde2E9PUP1 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Syde2E9PUP1 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Syde2E9PUP1 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Syde2E9PUP1 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Syde2E9PUP1 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Syde2E9PUP1 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Syde2E9PUP1 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Syde2E9PUP1 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Syde2E9PUP1 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Syde2E9PUP1 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Syde2E9PUP1 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms