Protein–RNA interactions for Protein: B2RX88

Cspp1, Centrosome and spindle pole associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cspp1B2RX88 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cspp1B2RX88 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cspp1B2RX88 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cspp1B2RX88 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cspp1B2RX88 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cspp1B2RX88 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Cspp1B2RX88 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cspp1B2RX88 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cspp1B2RX88 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cspp1B2RX88 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Cspp1B2RX88 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cspp1B2RX88 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cspp1B2RX88 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cspp1B2RX88 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cspp1B2RX88 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cspp1B2RX88 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cspp1B2RX88 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cspp1B2RX88 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cspp1B2RX88 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cspp1B2RX88 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cspp1B2RX88 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cspp1B2RX88 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cspp1B2RX88 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cspp1B2RX88 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cspp1B2RX88 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cspp1B2RX88 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Cspp1B2RX88 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cspp1B2RX88 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cspp1B2RX88 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cspp1B2RX88 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cspp1B2RX88 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cspp1B2RX88 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cspp1B2RX88 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cspp1B2RX88 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cspp1B2RX88 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cspp1B2RX88 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cspp1B2RX88 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cspp1B2RX88 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cspp1B2RX88 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cspp1B2RX88 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cspp1B2RX88 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Cspp1B2RX88 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Cspp1B2RX88 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cspp1B2RX88 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Cspp1B2RX88 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Cspp1B2RX88 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Cspp1B2RX88 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cspp1B2RX88 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cspp1B2RX88 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cspp1B2RX88 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cspp1B2RX88 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cspp1B2RX88 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cspp1B2RX88 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cspp1B2RX88 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cspp1B2RX88 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cspp1B2RX88 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cspp1B2RX88 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cspp1B2RX88 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cspp1B2RX88 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cspp1B2RX88 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cspp1B2RX88 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cspp1B2RX88 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cspp1B2RX88 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cspp1B2RX88 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cspp1B2RX88 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cspp1B2RX88 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cspp1B2RX88 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cspp1B2RX88 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cspp1B2RX88 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cspp1B2RX88 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Cspp1B2RX88 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cspp1B2RX88 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cspp1B2RX88 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Cspp1B2RX88 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cspp1B2RX88 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Cspp1B2RX88 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cspp1B2RX88 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cspp1B2RX88 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cspp1B2RX88 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Cspp1B2RX88 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cspp1B2RX88 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cspp1B2RX88 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cspp1B2RX88 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cspp1B2RX88 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cspp1B2RX88 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cspp1B2RX88 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cspp1B2RX88 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cspp1B2RX88 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Cspp1B2RX88 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cspp1B2RX88 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cspp1B2RX88 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cspp1B2RX88 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cspp1B2RX88 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cspp1B2RX88 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cspp1B2RX88 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Cspp1B2RX88 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cspp1B2RX88 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Cspp1B2RX88 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cspp1B2RX88 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cspp1B2RX88 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms