Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

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Length 936 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Spocd1B1ASB6 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Spocd1B1ASB6 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Spocd1B1ASB6 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Spocd1B1ASB6 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Spocd1B1ASB6 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Spocd1B1ASB6 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Spocd1B1ASB6 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Spocd1B1ASB6 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Spocd1B1ASB6 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Spocd1B1ASB6 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Spocd1B1ASB6 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Spocd1B1ASB6 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Spocd1B1ASB6 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Spocd1B1ASB6 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Spocd1B1ASB6 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Spocd1B1ASB6 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Spocd1B1ASB6 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Spocd1B1ASB6 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Spocd1B1ASB6 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Spocd1B1ASB6 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Spocd1B1ASB6 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Spocd1B1ASB6 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Spocd1B1ASB6 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Spocd1B1ASB6 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Spocd1B1ASB6 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Spocd1B1ASB6 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Spocd1B1ASB6 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Spocd1B1ASB6 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Spocd1B1ASB6 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Spocd1B1ASB6 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Spocd1B1ASB6 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Spocd1B1ASB6 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Spocd1B1ASB6 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Spocd1B1ASB6 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Spocd1B1ASB6 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Spocd1B1ASB6 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Spocd1B1ASB6 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Spocd1B1ASB6 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Spocd1B1ASB6 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Spocd1B1ASB6 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Spocd1B1ASB6 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Spocd1B1ASB6 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Spocd1B1ASB6 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Spocd1B1ASB6 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Spocd1B1ASB6 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Spocd1B1ASB6 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Spocd1B1ASB6 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Spocd1B1ASB6 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Spocd1B1ASB6 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Spocd1B1ASB6 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Spocd1B1ASB6 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Spocd1B1ASB6 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Spocd1B1ASB6 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Spocd1B1ASB6 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Spocd1B1ASB6 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Spocd1B1ASB6 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Spocd1B1ASB6 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Spocd1B1ASB6 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Spocd1B1ASB6 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Spocd1B1ASB6 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Spocd1B1ASB6 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Spocd1B1ASB6 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Spocd1B1ASB6 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Spocd1B1ASB6 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Spocd1B1ASB6 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Spocd1B1ASB6 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Spocd1B1ASB6 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Spocd1B1ASB6 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Spocd1B1ASB6 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Spocd1B1ASB6 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Spocd1B1ASB6 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Spocd1B1ASB6 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Spocd1B1ASB6 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Spocd1B1ASB6 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Spocd1B1ASB6 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Spocd1B1ASB6 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Spocd1B1ASB6 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Spocd1B1ASB6 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Spocd1B1ASB6 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Spocd1B1ASB6 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Spocd1B1ASB6 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Spocd1B1ASB6 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Spocd1B1ASB6 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Spocd1B1ASB6 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Spocd1B1ASB6 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Spocd1B1ASB6 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Spocd1B1ASB6 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Spocd1B1ASB6 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Spocd1B1ASB6 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Spocd1B1ASB6 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Spocd1B1ASB6 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Spocd1B1ASB6 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Spocd1B1ASB6 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Spocd1B1ASB6 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Spocd1B1ASB6 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Spocd1B1ASB6 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Spocd1B1ASB6 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Spocd1B1ASB6 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Spocd1B1ASB6 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
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