Protein–RNA interactions for Protein: A3KGV1

Odf2, Outer dense fiber protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf2A3KGV1 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Odf2A3KGV1 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Odf2A3KGV1 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Odf2A3KGV1 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Odf2A3KGV1 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Odf2A3KGV1 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Odf2A3KGV1 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Odf2A3KGV1 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Odf2A3KGV1 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Odf2A3KGV1 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Odf2A3KGV1 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Odf2A3KGV1 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Odf2A3KGV1 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Odf2A3KGV1 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Odf2A3KGV1 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Odf2A3KGV1 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Odf2A3KGV1 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Odf2A3KGV1 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Odf2A3KGV1 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Odf2A3KGV1 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Odf2A3KGV1 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Odf2A3KGV1 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Odf2A3KGV1 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Odf2A3KGV1 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Odf2A3KGV1 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Odf2A3KGV1 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Odf2A3KGV1 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Odf2A3KGV1 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Odf2A3KGV1 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Odf2A3KGV1 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Odf2A3KGV1 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Odf2A3KGV1 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Odf2A3KGV1 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Odf2A3KGV1 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Odf2A3KGV1 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Odf2A3KGV1 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Odf2A3KGV1 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Odf2A3KGV1 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Odf2A3KGV1 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Odf2A3KGV1 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Odf2A3KGV1 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Odf2A3KGV1 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Odf2A3KGV1 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Odf2A3KGV1 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Odf2A3KGV1 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Odf2A3KGV1 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Odf2A3KGV1 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Odf2A3KGV1 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Odf2A3KGV1 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Odf2A3KGV1 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Odf2A3KGV1 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Odf2A3KGV1 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Odf2A3KGV1 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Odf2A3KGV1 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Odf2A3KGV1 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Odf2A3KGV1 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Odf2A3KGV1 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Odf2A3KGV1 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Odf2A3KGV1 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Odf2A3KGV1 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Odf2A3KGV1 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Odf2A3KGV1 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Odf2A3KGV1 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Odf2A3KGV1 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Odf2A3KGV1 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Odf2A3KGV1 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Odf2A3KGV1 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Odf2A3KGV1 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Odf2A3KGV1 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Odf2A3KGV1 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Odf2A3KGV1 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Odf2A3KGV1 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Odf2A3KGV1 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Odf2A3KGV1 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Odf2A3KGV1 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Odf2A3KGV1 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Odf2A3KGV1 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Odf2A3KGV1 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Odf2A3KGV1 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Odf2A3KGV1 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Odf2A3KGV1 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Odf2A3KGV1 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Odf2A3KGV1 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Odf2A3KGV1 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Odf2A3KGV1 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Odf2A3KGV1 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Odf2A3KGV1 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Odf2A3KGV1 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Odf2A3KGV1 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Odf2A3KGV1 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Odf2A3KGV1 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Odf2A3KGV1 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Odf2A3KGV1 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Odf2A3KGV1 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Odf2A3KGV1 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Odf2A3KGV1 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Odf2A3KGV1 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Odf2A3KGV1 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Odf2A3KGV1 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Odf2A3KGV1 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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