Protein–RNA interactions for Protein: A2BED8

Samt1, Predicted gene 10057, mousemouse

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Length 237 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samt1A2BED8 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Samt1A2BED8 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Samt1A2BED8 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Samt1A2BED8 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Samt1A2BED8 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Samt1A2BED8 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Samt1A2BED8 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Samt1A2BED8 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Samt1A2BED8 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Samt1A2BED8 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Samt1A2BED8 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Samt1A2BED8 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Samt1A2BED8 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Samt1A2BED8 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Samt1A2BED8 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Samt1A2BED8 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Samt1A2BED8 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Samt1A2BED8 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Samt1A2BED8 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Samt1A2BED8 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Samt1A2BED8 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Samt1A2BED8 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Samt1A2BED8 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Samt1A2BED8 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Samt1A2BED8 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Samt1A2BED8 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Samt1A2BED8 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Samt1A2BED8 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Samt1A2BED8 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Samt1A2BED8 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Samt1A2BED8 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Samt1A2BED8 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Samt1A2BED8 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Samt1A2BED8 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Samt1A2BED8 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Samt1A2BED8 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Samt1A2BED8 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Samt1A2BED8 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Samt1A2BED8 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Samt1A2BED8 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Samt1A2BED8 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Samt1A2BED8 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Samt1A2BED8 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Samt1A2BED8 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Samt1A2BED8 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Samt1A2BED8 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Samt1A2BED8 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Samt1A2BED8 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Samt1A2BED8 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Samt1A2BED8 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Samt1A2BED8 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Samt1A2BED8 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Samt1A2BED8 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Samt1A2BED8 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Samt1A2BED8 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Samt1A2BED8 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Samt1A2BED8 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Samt1A2BED8 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Samt1A2BED8 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Samt1A2BED8 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Samt1A2BED8 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Samt1A2BED8 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Samt1A2BED8 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Samt1A2BED8 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Samt1A2BED8 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Samt1A2BED8 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Samt1A2BED8 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Samt1A2BED8 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Samt1A2BED8 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Samt1A2BED8 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Samt1A2BED8 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Samt1A2BED8 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Samt1A2BED8 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Samt1A2BED8 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Samt1A2BED8 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Samt1A2BED8 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Samt1A2BED8 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Samt1A2BED8 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Samt1A2BED8 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Samt1A2BED8 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Samt1A2BED8 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Samt1A2BED8 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Samt1A2BED8 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Samt1A2BED8 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Samt1A2BED8 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Samt1A2BED8 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Samt1A2BED8 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Samt1A2BED8 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Samt1A2BED8 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Samt1A2BED8 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Samt1A2BED8 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Samt1A2BED8 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Samt1A2BED8 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Samt1A2BED8 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Samt1A2BED8 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Samt1A2BED8 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Samt1A2BED8 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Samt1A2BED8 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Samt1A2BED8 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Samt1A2BED8 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
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