Protein–RNA interactions for Protein: A2ASI5

Scn3a, Sodium channel protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,947 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn3aA2ASI5 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scn3aA2ASI5 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scn3aA2ASI5 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scn3aA2ASI5 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scn3aA2ASI5 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scn3aA2ASI5 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scn3aA2ASI5 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Scn3aA2ASI5 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scn3aA2ASI5 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scn3aA2ASI5 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scn3aA2ASI5 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scn3aA2ASI5 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scn3aA2ASI5 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scn3aA2ASI5 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scn3aA2ASI5 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scn3aA2ASI5 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scn3aA2ASI5 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scn3aA2ASI5 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scn3aA2ASI5 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scn3aA2ASI5 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scn3aA2ASI5 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Scn3aA2ASI5 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scn3aA2ASI5 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scn3aA2ASI5 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scn3aA2ASI5 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scn3aA2ASI5 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scn3aA2ASI5 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scn3aA2ASI5 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scn3aA2ASI5 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scn3aA2ASI5 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scn3aA2ASI5 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scn3aA2ASI5 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Scn3aA2ASI5 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Scn3aA2ASI5 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Scn3aA2ASI5 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Scn3aA2ASI5 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scn3aA2ASI5 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scn3aA2ASI5 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scn3aA2ASI5 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scn3aA2ASI5 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scn3aA2ASI5 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scn3aA2ASI5 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scn3aA2ASI5 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scn3aA2ASI5 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scn3aA2ASI5 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scn3aA2ASI5 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scn3aA2ASI5 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Scn3aA2ASI5 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Scn3aA2ASI5 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scn3aA2ASI5 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scn3aA2ASI5 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scn3aA2ASI5 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scn3aA2ASI5 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scn3aA2ASI5 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scn3aA2ASI5 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scn3aA2ASI5 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scn3aA2ASI5 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scn3aA2ASI5 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scn3aA2ASI5 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scn3aA2ASI5 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scn3aA2ASI5 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scn3aA2ASI5 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scn3aA2ASI5 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scn3aA2ASI5 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scn3aA2ASI5 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scn3aA2ASI5 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scn3aA2ASI5 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scn3aA2ASI5 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scn3aA2ASI5 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scn3aA2ASI5 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scn3aA2ASI5 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scn3aA2ASI5 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scn3aA2ASI5 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scn3aA2ASI5 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scn3aA2ASI5 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Scn3aA2ASI5 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scn3aA2ASI5 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scn3aA2ASI5 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scn3aA2ASI5 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Scn3aA2ASI5 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Scn3aA2ASI5 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Scn3aA2ASI5 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scn3aA2ASI5 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scn3aA2ASI5 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Scn3aA2ASI5 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Scn3aA2ASI5 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scn3aA2ASI5 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scn3aA2ASI5 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Scn3aA2ASI5 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scn3aA2ASI5 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scn3aA2ASI5 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scn3aA2ASI5 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scn3aA2ASI5 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scn3aA2ASI5 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scn3aA2ASI5 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scn3aA2ASI5 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Scn3aA2ASI5 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scn3aA2ASI5 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scn3aA2ASI5 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scn3aA2ASI5 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms