Protein–RNA interactions for Protein: A2ANU3

Syndig1, Synapse differentiation-inducing gene protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syndig1A2ANU3 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Syndig1A2ANU3 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Syndig1A2ANU3 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Syndig1A2ANU3 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Syndig1A2ANU3 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Syndig1A2ANU3 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Syndig1A2ANU3 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Syndig1A2ANU3 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Syndig1A2ANU3 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Syndig1A2ANU3 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Syndig1A2ANU3 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Syndig1A2ANU3 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Syndig1A2ANU3 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Syndig1A2ANU3 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Syndig1A2ANU3 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Syndig1A2ANU3 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Syndig1A2ANU3 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Syndig1A2ANU3 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Syndig1A2ANU3 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Syndig1A2ANU3 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Syndig1A2ANU3 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Syndig1A2ANU3 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Syndig1A2ANU3 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Syndig1A2ANU3 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Syndig1A2ANU3 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Syndig1A2ANU3 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Syndig1A2ANU3 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Syndig1A2ANU3 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Syndig1A2ANU3 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Syndig1A2ANU3 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Syndig1A2ANU3 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Syndig1A2ANU3 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Syndig1A2ANU3 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Syndig1A2ANU3 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Syndig1A2ANU3 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Syndig1A2ANU3 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Syndig1A2ANU3 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Syndig1A2ANU3 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Syndig1A2ANU3 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Syndig1A2ANU3 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Syndig1A2ANU3 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Syndig1A2ANU3 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Syndig1A2ANU3 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Syndig1A2ANU3 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Syndig1A2ANU3 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Syndig1A2ANU3 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Syndig1A2ANU3 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Syndig1A2ANU3 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Syndig1A2ANU3 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Syndig1A2ANU3 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Syndig1A2ANU3 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Syndig1A2ANU3 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Syndig1A2ANU3 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Syndig1A2ANU3 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Syndig1A2ANU3 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Syndig1A2ANU3 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Syndig1A2ANU3 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Syndig1A2ANU3 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Syndig1A2ANU3 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Syndig1A2ANU3 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Syndig1A2ANU3 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Syndig1A2ANU3 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Syndig1A2ANU3 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Syndig1A2ANU3 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Syndig1A2ANU3 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Syndig1A2ANU3 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Syndig1A2ANU3 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Syndig1A2ANU3 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Syndig1A2ANU3 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Syndig1A2ANU3 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Syndig1A2ANU3 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Syndig1A2ANU3 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Syndig1A2ANU3 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Syndig1A2ANU3 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Syndig1A2ANU3 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Syndig1A2ANU3 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Syndig1A2ANU3 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Syndig1A2ANU3 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Syndig1A2ANU3 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Syndig1A2ANU3 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Syndig1A2ANU3 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Syndig1A2ANU3 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Syndig1A2ANU3 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Syndig1A2ANU3 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Syndig1A2ANU3 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Syndig1A2ANU3 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Syndig1A2ANU3 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Syndig1A2ANU3 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Syndig1A2ANU3 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Syndig1A2ANU3 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Syndig1A2ANU3 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Syndig1A2ANU3 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Syndig1A2ANU3 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Syndig1A2ANU3 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Syndig1A2ANU3 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Syndig1A2ANU3 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Syndig1A2ANU3 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Syndig1A2ANU3 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Syndig1A2ANU3 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Syndig1A2ANU3 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms