Protein–RNA interactions for Protein: A2AMW3

Gabre, Gamma-aminobutyric acid (GABA) A receptor, subunit epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GabreA2AMW3 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GabreA2AMW3 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GabreA2AMW3 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GabreA2AMW3 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GabreA2AMW3 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GabreA2AMW3 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GabreA2AMW3 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GabreA2AMW3 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
GabreA2AMW3 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GabreA2AMW3 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GabreA2AMW3 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GabreA2AMW3 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
GabreA2AMW3 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GabreA2AMW3 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GabreA2AMW3 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GabreA2AMW3 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GabreA2AMW3 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
GabreA2AMW3 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GabreA2AMW3 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
GabreA2AMW3 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
GabreA2AMW3 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
GabreA2AMW3 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GabreA2AMW3 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GabreA2AMW3 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GabreA2AMW3 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GabreA2AMW3 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GabreA2AMW3 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GabreA2AMW3 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GabreA2AMW3 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GabreA2AMW3 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GabreA2AMW3 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
GabreA2AMW3 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GabreA2AMW3 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GabreA2AMW3 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GabreA2AMW3 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GabreA2AMW3 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GabreA2AMW3 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GabreA2AMW3 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GabreA2AMW3 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GabreA2AMW3 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GabreA2AMW3 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GabreA2AMW3 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GabreA2AMW3 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GabreA2AMW3 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GabreA2AMW3 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GabreA2AMW3 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GabreA2AMW3 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
GabreA2AMW3 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GabreA2AMW3 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GabreA2AMW3 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GabreA2AMW3 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GabreA2AMW3 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GabreA2AMW3 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GabreA2AMW3 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GabreA2AMW3 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GabreA2AMW3 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GabreA2AMW3 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
GabreA2AMW3 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
GabreA2AMW3 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GabreA2AMW3 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
GabreA2AMW3 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GabreA2AMW3 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GabreA2AMW3 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GabreA2AMW3 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GabreA2AMW3 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GabreA2AMW3 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GabreA2AMW3 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GabreA2AMW3 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GabreA2AMW3 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GabreA2AMW3 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GabreA2AMW3 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GabreA2AMW3 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GabreA2AMW3 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GabreA2AMW3 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
GabreA2AMW3 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
GabreA2AMW3 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GabreA2AMW3 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GabreA2AMW3 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
GabreA2AMW3 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
GabreA2AMW3 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GabreA2AMW3 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GabreA2AMW3 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GabreA2AMW3 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GabreA2AMW3 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GabreA2AMW3 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GabreA2AMW3 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GabreA2AMW3 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
GabreA2AMW3 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GabreA2AMW3 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GabreA2AMW3 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GabreA2AMW3 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GabreA2AMW3 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GabreA2AMW3 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GabreA2AMW3 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GabreA2AMW3 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GabreA2AMW3 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GabreA2AMW3 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GabreA2AMW3 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GabreA2AMW3 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GabreA2AMW3 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms