Protein–RNA interactions for Protein: A2AHA7

Pramel3, Preferentially-expressed antigen in melanoma-like 3, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramel3A2AHA7 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pramel3A2AHA7 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pramel3A2AHA7 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pramel3A2AHA7 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pramel3A2AHA7 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pramel3A2AHA7 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pramel3A2AHA7 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pramel3A2AHA7 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Pramel3A2AHA7 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Pramel3A2AHA7 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pramel3A2AHA7 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pramel3A2AHA7 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pramel3A2AHA7 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Pramel3A2AHA7 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pramel3A2AHA7 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pramel3A2AHA7 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pramel3A2AHA7 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pramel3A2AHA7 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Pramel3A2AHA7 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pramel3A2AHA7 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Pramel3A2AHA7 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Pramel3A2AHA7 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pramel3A2AHA7 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pramel3A2AHA7 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pramel3A2AHA7 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pramel3A2AHA7 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pramel3A2AHA7 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pramel3A2AHA7 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pramel3A2AHA7 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pramel3A2AHA7 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pramel3A2AHA7 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pramel3A2AHA7 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pramel3A2AHA7 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pramel3A2AHA7 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pramel3A2AHA7 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pramel3A2AHA7 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pramel3A2AHA7 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pramel3A2AHA7 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pramel3A2AHA7 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pramel3A2AHA7 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pramel3A2AHA7 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pramel3A2AHA7 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pramel3A2AHA7 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pramel3A2AHA7 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pramel3A2AHA7 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pramel3A2AHA7 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pramel3A2AHA7 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pramel3A2AHA7 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pramel3A2AHA7 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pramel3A2AHA7 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pramel3A2AHA7 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pramel3A2AHA7 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pramel3A2AHA7 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Pramel3A2AHA7 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pramel3A2AHA7 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Pramel3A2AHA7 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pramel3A2AHA7 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Pramel3A2AHA7 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pramel3A2AHA7 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pramel3A2AHA7 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pramel3A2AHA7 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Pramel3A2AHA7 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pramel3A2AHA7 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pramel3A2AHA7 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pramel3A2AHA7 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pramel3A2AHA7 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pramel3A2AHA7 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pramel3A2AHA7 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pramel3A2AHA7 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pramel3A2AHA7 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pramel3A2AHA7 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pramel3A2AHA7 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pramel3A2AHA7 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pramel3A2AHA7 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pramel3A2AHA7 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pramel3A2AHA7 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pramel3A2AHA7 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pramel3A2AHA7 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pramel3A2AHA7 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pramel3A2AHA7 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pramel3A2AHA7 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pramel3A2AHA7 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pramel3A2AHA7 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pramel3A2AHA7 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pramel3A2AHA7 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pramel3A2AHA7 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Pramel3A2AHA7 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pramel3A2AHA7 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Pramel3A2AHA7 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Pramel3A2AHA7 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Pramel3A2AHA7 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pramel3A2AHA7 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pramel3A2AHA7 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pramel3A2AHA7 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pramel3A2AHA7 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pramel3A2AHA7 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pramel3A2AHA7 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pramel3A2AHA7 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pramel3A2AHA7 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pramel3A2AHA7 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms