Protein–RNA interactions for Protein: A2ABX0

Rbbp8nl, RBBP8 N-terminal-like, mousemouse

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp8nlA2ABX0 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rbbp8nlA2ABX0 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rbbp8nlA2ABX0 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rbbp8nlA2ABX0 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rbbp8nlA2ABX0 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rbbp8nlA2ABX0 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rbbp8nlA2ABX0 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rbbp8nlA2ABX0 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rbbp8nlA2ABX0 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rbbp8nlA2ABX0 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rbbp8nlA2ABX0 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rbbp8nlA2ABX0 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rbbp8nlA2ABX0 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rbbp8nlA2ABX0 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rbbp8nlA2ABX0 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rbbp8nlA2ABX0 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rbbp8nlA2ABX0 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rbbp8nlA2ABX0 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Rbbp8nlA2ABX0 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rbbp8nlA2ABX0 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rbbp8nlA2ABX0 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Rbbp8nlA2ABX0 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rbbp8nlA2ABX0 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rbbp8nlA2ABX0 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rbbp8nlA2ABX0 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rbbp8nlA2ABX0 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rbbp8nlA2ABX0 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rbbp8nlA2ABX0 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rbbp8nlA2ABX0 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rbbp8nlA2ABX0 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Rbbp8nlA2ABX0 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rbbp8nlA2ABX0 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rbbp8nlA2ABX0 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rbbp8nlA2ABX0 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Rbbp8nlA2ABX0 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rbbp8nlA2ABX0 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rbbp8nlA2ABX0 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rbbp8nlA2ABX0 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rbbp8nlA2ABX0 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rbbp8nlA2ABX0 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rbbp8nlA2ABX0 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rbbp8nlA2ABX0 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rbbp8nlA2ABX0 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rbbp8nlA2ABX0 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rbbp8nlA2ABX0 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rbbp8nlA2ABX0 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rbbp8nlA2ABX0 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rbbp8nlA2ABX0 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rbbp8nlA2ABX0 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Rbbp8nlA2ABX0 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Rbbp8nlA2ABX0 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rbbp8nlA2ABX0 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rbbp8nlA2ABX0 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Rbbp8nlA2ABX0 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Rbbp8nlA2ABX0 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rbbp8nlA2ABX0 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rbbp8nlA2ABX0 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rbbp8nlA2ABX0 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rbbp8nlA2ABX0 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rbbp8nlA2ABX0 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rbbp8nlA2ABX0 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rbbp8nlA2ABX0 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rbbp8nlA2ABX0 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rbbp8nlA2ABX0 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rbbp8nlA2ABX0 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rbbp8nlA2ABX0 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rbbp8nlA2ABX0 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rbbp8nlA2ABX0 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rbbp8nlA2ABX0 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rbbp8nlA2ABX0 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rbbp8nlA2ABX0 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rbbp8nlA2ABX0 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rbbp8nlA2ABX0 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Rbbp8nlA2ABX0 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rbbp8nlA2ABX0 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rbbp8nlA2ABX0 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rbbp8nlA2ABX0 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rbbp8nlA2ABX0 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rbbp8nlA2ABX0 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Rbbp8nlA2ABX0 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Rbbp8nlA2ABX0 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rbbp8nlA2ABX0 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rbbp8nlA2ABX0 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rbbp8nlA2ABX0 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rbbp8nlA2ABX0 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rbbp8nlA2ABX0 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rbbp8nlA2ABX0 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rbbp8nlA2ABX0 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rbbp8nlA2ABX0 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rbbp8nlA2ABX0 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rbbp8nlA2ABX0 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rbbp8nlA2ABX0 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rbbp8nlA2ABX0 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rbbp8nlA2ABX0 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rbbp8nlA2ABX0 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rbbp8nlA2ABX0 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rbbp8nlA2ABX0 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rbbp8nlA2ABX0 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rbbp8nlA2ABX0 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rbbp8nlA2ABX0 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms