Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Y3

Homer1, Homer protein homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Homer1Q9Z2Y3 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Homer1Q9Z2Y3 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Homer1Q9Z2Y3 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Homer1Q9Z2Y3 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Homer1Q9Z2Y3 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Homer1Q9Z2Y3 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Homer1Q9Z2Y3 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Homer1Q9Z2Y3 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Homer1Q9Z2Y3 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Homer1Q9Z2Y3 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Homer1Q9Z2Y3 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Homer1Q9Z2Y3 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Homer1Q9Z2Y3 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Homer1Q9Z2Y3 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Homer1Q9Z2Y3 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Homer1Q9Z2Y3 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Homer1Q9Z2Y3 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Homer1Q9Z2Y3 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Homer1Q9Z2Y3 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Homer1Q9Z2Y3 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Homer1Q9Z2Y3 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Homer1Q9Z2Y3 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Homer1Q9Z2Y3 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Homer1Q9Z2Y3 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Homer1Q9Z2Y3 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Homer1Q9Z2Y3 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Homer1Q9Z2Y3 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Homer1Q9Z2Y3 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Homer1Q9Z2Y3 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Homer1Q9Z2Y3 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Homer1Q9Z2Y3 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Homer1Q9Z2Y3 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Homer1Q9Z2Y3 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Homer1Q9Z2Y3 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Homer1Q9Z2Y3 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Homer1Q9Z2Y3 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Homer1Q9Z2Y3 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Homer1Q9Z2Y3 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Homer1Q9Z2Y3 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Homer1Q9Z2Y3 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Homer1Q9Z2Y3 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Homer1Q9Z2Y3 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Homer1Q9Z2Y3 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Homer1Q9Z2Y3 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Homer1Q9Z2Y3 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Homer1Q9Z2Y3 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Homer1Q9Z2Y3 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Homer1Q9Z2Y3 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Homer1Q9Z2Y3 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Homer1Q9Z2Y3 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Homer1Q9Z2Y3 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Homer1Q9Z2Y3 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Homer1Q9Z2Y3 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Homer1Q9Z2Y3 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Homer1Q9Z2Y3 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Homer1Q9Z2Y3 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Homer1Q9Z2Y3 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Homer1Q9Z2Y3 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Homer1Q9Z2Y3 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Homer1Q9Z2Y3 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Homer1Q9Z2Y3 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Homer1Q9Z2Y3 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Homer1Q9Z2Y3 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Homer1Q9Z2Y3 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Homer1Q9Z2Y3 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Homer1Q9Z2Y3 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Homer1Q9Z2Y3 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Homer1Q9Z2Y3 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Homer1Q9Z2Y3 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Homer1Q9Z2Y3 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Homer1Q9Z2Y3 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Homer1Q9Z2Y3 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Homer1Q9Z2Y3 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Homer1Q9Z2Y3 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Homer1Q9Z2Y3 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Homer1Q9Z2Y3 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Homer1Q9Z2Y3 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Homer1Q9Z2Y3 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Homer1Q9Z2Y3 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Homer1Q9Z2Y3 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Homer1Q9Z2Y3 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Homer1Q9Z2Y3 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Homer1Q9Z2Y3 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Homer1Q9Z2Y3 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Homer1Q9Z2Y3 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Homer1Q9Z2Y3 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Homer1Q9Z2Y3 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Homer1Q9Z2Y3 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Homer1Q9Z2Y3 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Homer1Q9Z2Y3 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Homer1Q9Z2Y3 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Homer1Q9Z2Y3 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Homer1Q9Z2Y3 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Homer1Q9Z2Y3 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Homer1Q9Z2Y3 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Homer1Q9Z2Y3 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Homer1Q9Z2Y3 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Homer1Q9Z2Y3 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Homer1Q9Z2Y3 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Homer1Q9Z2Y3 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms