Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Q2

Knop1, Lysine-rich nucleolar protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Knop1Q9Z2Q2 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Knop1Q9Z2Q2 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Knop1Q9Z2Q2 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Knop1Q9Z2Q2 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Knop1Q9Z2Q2 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Knop1Q9Z2Q2 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Knop1Q9Z2Q2 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Knop1Q9Z2Q2 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Knop1Q9Z2Q2 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Knop1Q9Z2Q2 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Knop1Q9Z2Q2 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Knop1Q9Z2Q2 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Knop1Q9Z2Q2 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Knop1Q9Z2Q2 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Knop1Q9Z2Q2 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Knop1Q9Z2Q2 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Knop1Q9Z2Q2 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Knop1Q9Z2Q2 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Knop1Q9Z2Q2 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Knop1Q9Z2Q2 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Knop1Q9Z2Q2 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Knop1Q9Z2Q2 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Knop1Q9Z2Q2 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Knop1Q9Z2Q2 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Knop1Q9Z2Q2 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Knop1Q9Z2Q2 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Knop1Q9Z2Q2 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Knop1Q9Z2Q2 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Knop1Q9Z2Q2 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Knop1Q9Z2Q2 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Knop1Q9Z2Q2 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Knop1Q9Z2Q2 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Knop1Q9Z2Q2 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Knop1Q9Z2Q2 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Knop1Q9Z2Q2 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Knop1Q9Z2Q2 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Knop1Q9Z2Q2 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Knop1Q9Z2Q2 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Knop1Q9Z2Q2 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Knop1Q9Z2Q2 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Knop1Q9Z2Q2 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Knop1Q9Z2Q2 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Knop1Q9Z2Q2 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Knop1Q9Z2Q2 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Knop1Q9Z2Q2 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Knop1Q9Z2Q2 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Knop1Q9Z2Q2 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Knop1Q9Z2Q2 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Knop1Q9Z2Q2 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Knop1Q9Z2Q2 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Knop1Q9Z2Q2 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Knop1Q9Z2Q2 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Knop1Q9Z2Q2 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Knop1Q9Z2Q2 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Knop1Q9Z2Q2 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Knop1Q9Z2Q2 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Knop1Q9Z2Q2 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Knop1Q9Z2Q2 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Knop1Q9Z2Q2 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Knop1Q9Z2Q2 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Knop1Q9Z2Q2 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Knop1Q9Z2Q2 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Knop1Q9Z2Q2 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Knop1Q9Z2Q2 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Knop1Q9Z2Q2 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Knop1Q9Z2Q2 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Knop1Q9Z2Q2 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Knop1Q9Z2Q2 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Knop1Q9Z2Q2 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Knop1Q9Z2Q2 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Knop1Q9Z2Q2 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Knop1Q9Z2Q2 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Knop1Q9Z2Q2 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Knop1Q9Z2Q2 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Knop1Q9Z2Q2 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Knop1Q9Z2Q2 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Knop1Q9Z2Q2 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Knop1Q9Z2Q2 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Knop1Q9Z2Q2 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Knop1Q9Z2Q2 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Knop1Q9Z2Q2 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Knop1Q9Z2Q2 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Knop1Q9Z2Q2 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Knop1Q9Z2Q2 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Knop1Q9Z2Q2 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Knop1Q9Z2Q2 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Knop1Q9Z2Q2 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Knop1Q9Z2Q2 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Knop1Q9Z2Q2 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Knop1Q9Z2Q2 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Knop1Q9Z2Q2 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Knop1Q9Z2Q2 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Knop1Q9Z2Q2 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Knop1Q9Z2Q2 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Knop1Q9Z2Q2 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Knop1Q9Z2Q2 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Knop1Q9Z2Q2 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Knop1Q9Z2Q2 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Knop1Q9Z2Q2 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Knop1Q9Z2Q2 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms