Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z121

Ccl8, C-C motif chemokine 8, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl8Q9Z121 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccl8Q9Z121 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccl8Q9Z121 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccl8Q9Z121 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccl8Q9Z121 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccl8Q9Z121 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccl8Q9Z121 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccl8Q9Z121 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccl8Q9Z121 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccl8Q9Z121 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccl8Q9Z121 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccl8Q9Z121 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccl8Q9Z121 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccl8Q9Z121 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccl8Q9Z121 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccl8Q9Z121 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccl8Q9Z121 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccl8Q9Z121 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccl8Q9Z121 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccl8Q9Z121 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccl8Q9Z121 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccl8Q9Z121 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccl8Q9Z121 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccl8Q9Z121 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccl8Q9Z121 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccl8Q9Z121 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccl8Q9Z121 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccl8Q9Z121 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccl8Q9Z121 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccl8Q9Z121 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccl8Q9Z121 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccl8Q9Z121 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccl8Q9Z121 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccl8Q9Z121 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccl8Q9Z121 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccl8Q9Z121 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccl8Q9Z121 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccl8Q9Z121 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccl8Q9Z121 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccl8Q9Z121 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccl8Q9Z121 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccl8Q9Z121 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccl8Q9Z121 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccl8Q9Z121 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccl8Q9Z121 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccl8Q9Z121 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccl8Q9Z121 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccl8Q9Z121 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccl8Q9Z121 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccl8Q9Z121 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccl8Q9Z121 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccl8Q9Z121 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccl8Q9Z121 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccl8Q9Z121 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccl8Q9Z121 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccl8Q9Z121 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccl8Q9Z121 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccl8Q9Z121 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccl8Q9Z121 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccl8Q9Z121 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccl8Q9Z121 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccl8Q9Z121 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccl8Q9Z121 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccl8Q9Z121 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccl8Q9Z121 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccl8Q9Z121 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccl8Q9Z121 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccl8Q9Z121 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccl8Q9Z121 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccl8Q9Z121 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccl8Q9Z121 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccl8Q9Z121 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccl8Q9Z121 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccl8Q9Z121 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccl8Q9Z121 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccl8Q9Z121 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccl8Q9Z121 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccl8Q9Z121 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccl8Q9Z121 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccl8Q9Z121 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccl8Q9Z121 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccl8Q9Z121 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccl8Q9Z121 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccl8Q9Z121 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccl8Q9Z121 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccl8Q9Z121 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccl8Q9Z121 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccl8Q9Z121 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccl8Q9Z121 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccl8Q9Z121 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccl8Q9Z121 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccl8Q9Z121 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccl8Q9Z121 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccl8Q9Z121 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccl8Q9Z121 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccl8Q9Z121 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccl8Q9Z121 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccl8Q9Z121 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccl8Q9Z121 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccl8Q9Z121 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms