Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV89

Stxbp4, Syntaxin-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stxbp4Q9WV89 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Stxbp4Q9WV89 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Stxbp4Q9WV89 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Stxbp4Q9WV89 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Stxbp4Q9WV89 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Stxbp4Q9WV89 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Stxbp4Q9WV89 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Stxbp4Q9WV89 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Stxbp4Q9WV89 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Stxbp4Q9WV89 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Stxbp4Q9WV89 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Stxbp4Q9WV89 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Stxbp4Q9WV89 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Stxbp4Q9WV89 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Stxbp4Q9WV89 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Stxbp4Q9WV89 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Stxbp4Q9WV89 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Stxbp4Q9WV89 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Stxbp4Q9WV89 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Stxbp4Q9WV89 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Stxbp4Q9WV89 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Stxbp4Q9WV89 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Stxbp4Q9WV89 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Stxbp4Q9WV89 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Stxbp4Q9WV89 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Stxbp4Q9WV89 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Stxbp4Q9WV89 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Stxbp4Q9WV89 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Stxbp4Q9WV89 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Stxbp4Q9WV89 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Stxbp4Q9WV89 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Stxbp4Q9WV89 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Stxbp4Q9WV89 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Stxbp4Q9WV89 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Stxbp4Q9WV89 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Stxbp4Q9WV89 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Stxbp4Q9WV89 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Stxbp4Q9WV89 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Stxbp4Q9WV89 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Stxbp4Q9WV89 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Stxbp4Q9WV89 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Stxbp4Q9WV89 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Stxbp4Q9WV89 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Stxbp4Q9WV89 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Stxbp4Q9WV89 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Stxbp4Q9WV89 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Stxbp4Q9WV89 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Stxbp4Q9WV89 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Stxbp4Q9WV89 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Stxbp4Q9WV89 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Stxbp4Q9WV89 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Stxbp4Q9WV89 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Stxbp4Q9WV89 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Stxbp4Q9WV89 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Stxbp4Q9WV89 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Stxbp4Q9WV89 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Stxbp4Q9WV89 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Stxbp4Q9WV89 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Stxbp4Q9WV89 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Stxbp4Q9WV89 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Stxbp4Q9WV89 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Stxbp4Q9WV89 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Stxbp4Q9WV89 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Stxbp4Q9WV89 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Stxbp4Q9WV89 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Stxbp4Q9WV89 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Stxbp4Q9WV89 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Stxbp4Q9WV89 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Stxbp4Q9WV89 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Stxbp4Q9WV89 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Stxbp4Q9WV89 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Stxbp4Q9WV89 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Stxbp4Q9WV89 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Stxbp4Q9WV89 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Stxbp4Q9WV89 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Stxbp4Q9WV89 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Stxbp4Q9WV89 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Stxbp4Q9WV89 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Stxbp4Q9WV89 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Stxbp4Q9WV89 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Stxbp4Q9WV89 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Stxbp4Q9WV89 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Stxbp4Q9WV89 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Stxbp4Q9WV89 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Stxbp4Q9WV89 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Stxbp4Q9WV89 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Stxbp4Q9WV89 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Stxbp4Q9WV89 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Stxbp4Q9WV89 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Stxbp4Q9WV89 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Stxbp4Q9WV89 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Stxbp4Q9WV89 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Stxbp4Q9WV89 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Stxbp4Q9WV89 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Stxbp4Q9WV89 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Stxbp4Q9WV89 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Stxbp4Q9WV89 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Stxbp4Q9WV89 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Stxbp4Q9WV89 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Stxbp4Q9WV89 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.1 ms