Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU72

Tnfsf13b, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 13B, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf13bQ9WU72 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfsf13bQ9WU72 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfsf13bQ9WU72 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfsf13bQ9WU72 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfsf13bQ9WU72 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfsf13bQ9WU72 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfsf13bQ9WU72 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfsf13bQ9WU72 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfsf13bQ9WU72 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfsf13bQ9WU72 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfsf13bQ9WU72 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfsf13bQ9WU72 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfsf13bQ9WU72 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfsf13bQ9WU72 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfsf13bQ9WU72 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfsf13bQ9WU72 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfsf13bQ9WU72 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfsf13bQ9WU72 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfsf13bQ9WU72 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfsf13bQ9WU72 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfsf13bQ9WU72 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfsf13bQ9WU72 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfsf13bQ9WU72 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfsf13bQ9WU72 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfsf13bQ9WU72 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfsf13bQ9WU72 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfsf13bQ9WU72 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfsf13bQ9WU72 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfsf13bQ9WU72 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfsf13bQ9WU72 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfsf13bQ9WU72 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfsf13bQ9WU72 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfsf13bQ9WU72 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfsf13bQ9WU72 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfsf13bQ9WU72 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfsf13bQ9WU72 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfsf13bQ9WU72 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfsf13bQ9WU72 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfsf13bQ9WU72 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfsf13bQ9WU72 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfsf13bQ9WU72 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfsf13bQ9WU72 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfsf13bQ9WU72 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfsf13bQ9WU72 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfsf13bQ9WU72 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfsf13bQ9WU72 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfsf13bQ9WU72 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfsf13bQ9WU72 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfsf13bQ9WU72 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfsf13bQ9WU72 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfsf13bQ9WU72 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfsf13bQ9WU72 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfsf13bQ9WU72 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfsf13bQ9WU72 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfsf13bQ9WU72 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfsf13bQ9WU72 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfsf13bQ9WU72 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tnfsf13bQ9WU72 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tnfsf13bQ9WU72 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tnfsf13bQ9WU72 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tnfsf13bQ9WU72 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tnfsf13bQ9WU72 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfsf13bQ9WU72 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfsf13bQ9WU72 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfsf13bQ9WU72 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfsf13bQ9WU72 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfsf13bQ9WU72 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfsf13bQ9WU72 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfsf13bQ9WU72 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfsf13bQ9WU72 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Tnfsf13bQ9WU72 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Tnfsf13bQ9WU72 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Tnfsf13bQ9WU72 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfsf13bQ9WU72 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfsf13bQ9WU72 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfsf13bQ9WU72 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfsf13bQ9WU72 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfsf13bQ9WU72 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfsf13bQ9WU72 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfsf13bQ9WU72 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfsf13bQ9WU72 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Tnfsf13bQ9WU72 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfsf13bQ9WU72 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfsf13bQ9WU72 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfsf13bQ9WU72 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Tnfsf13bQ9WU72 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfsf13bQ9WU72 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfsf13bQ9WU72 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfsf13bQ9WU72 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfsf13bQ9WU72 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfsf13bQ9WU72 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfsf13bQ9WU72 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfsf13bQ9WU72 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfsf13bQ9WU72 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfsf13bQ9WU72 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfsf13bQ9WU72 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfsf13bQ9WU72 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfsf13bQ9WU72 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfsf13bQ9WU72 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfsf13bQ9WU72 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms