Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0B6

Lamc3, Laminin subunit gamma-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamc3Q9R0B6 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lamc3Q9R0B6 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lamc3Q9R0B6 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Lamc3Q9R0B6 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lamc3Q9R0B6 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lamc3Q9R0B6 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lamc3Q9R0B6 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lamc3Q9R0B6 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lamc3Q9R0B6 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lamc3Q9R0B6 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Lamc3Q9R0B6 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lamc3Q9R0B6 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Lamc3Q9R0B6 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lamc3Q9R0B6 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Lamc3Q9R0B6 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lamc3Q9R0B6 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Lamc3Q9R0B6 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Lamc3Q9R0B6 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lamc3Q9R0B6 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lamc3Q9R0B6 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lamc3Q9R0B6 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lamc3Q9R0B6 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lamc3Q9R0B6 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lamc3Q9R0B6 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lamc3Q9R0B6 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lamc3Q9R0B6 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lamc3Q9R0B6 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Lamc3Q9R0B6 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lamc3Q9R0B6 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lamc3Q9R0B6 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lamc3Q9R0B6 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lamc3Q9R0B6 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Lamc3Q9R0B6 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Lamc3Q9R0B6 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Lamc3Q9R0B6 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lamc3Q9R0B6 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lamc3Q9R0B6 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lamc3Q9R0B6 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lamc3Q9R0B6 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lamc3Q9R0B6 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lamc3Q9R0B6 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lamc3Q9R0B6 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lamc3Q9R0B6 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lamc3Q9R0B6 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Lamc3Q9R0B6 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Lamc3Q9R0B6 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lamc3Q9R0B6 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lamc3Q9R0B6 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lamc3Q9R0B6 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lamc3Q9R0B6 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lamc3Q9R0B6 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lamc3Q9R0B6 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lamc3Q9R0B6 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lamc3Q9R0B6 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lamc3Q9R0B6 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lamc3Q9R0B6 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lamc3Q9R0B6 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lamc3Q9R0B6 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lamc3Q9R0B6 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lamc3Q9R0B6 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lamc3Q9R0B6 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lamc3Q9R0B6 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lamc3Q9R0B6 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lamc3Q9R0B6 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lamc3Q9R0B6 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lamc3Q9R0B6 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lamc3Q9R0B6 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lamc3Q9R0B6 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lamc3Q9R0B6 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Lamc3Q9R0B6 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lamc3Q9R0B6 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lamc3Q9R0B6 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Lamc3Q9R0B6 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lamc3Q9R0B6 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Lamc3Q9R0B6 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lamc3Q9R0B6 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lamc3Q9R0B6 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lamc3Q9R0B6 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lamc3Q9R0B6 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lamc3Q9R0B6 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lamc3Q9R0B6 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
Lamc3Q9R0B6 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Lamc3Q9R0B6 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Lamc3Q9R0B6 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Lamc3Q9R0B6 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Lamc3Q9R0B6 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
Lamc3Q9R0B6 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Lamc3Q9R0B6 Rpl10a-201ENSMUST00000042334 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Lamc3Q9R0B6 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
Lamc3Q9R0B6 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Lamc3Q9R0B6 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lamc3Q9R0B6 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lamc3Q9R0B6 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lamc3Q9R0B6 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lamc3Q9R0B6 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lamc3Q9R0B6 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lamc3Q9R0B6 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lamc3Q9R0B6 Gm14263-201ENSMUST00000117955 746 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Lamc3Q9R0B6 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lamc3Q9R0B6 Gm22334-201ENSMUST00000158070 133 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms