Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZL0

Ripk3, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 3, mousemouse

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Length 486 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ripk3Q9QZL0 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ripk3Q9QZL0 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ripk3Q9QZL0 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ripk3Q9QZL0 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ripk3Q9QZL0 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ripk3Q9QZL0 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ripk3Q9QZL0 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ripk3Q9QZL0 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ripk3Q9QZL0 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ripk3Q9QZL0 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ripk3Q9QZL0 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ripk3Q9QZL0 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ripk3Q9QZL0 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ripk3Q9QZL0 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ripk3Q9QZL0 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ripk3Q9QZL0 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ripk3Q9QZL0 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ripk3Q9QZL0 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ripk3Q9QZL0 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ripk3Q9QZL0 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ripk3Q9QZL0 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ripk3Q9QZL0 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ripk3Q9QZL0 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ripk3Q9QZL0 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ripk3Q9QZL0 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ripk3Q9QZL0 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ripk3Q9QZL0 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ripk3Q9QZL0 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ripk3Q9QZL0 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
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Ripk3Q9QZL0 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ripk3Q9QZL0 Gm42817-201ENSMUST00000198962 607 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ripk3Q9QZL0 Gm8959-201ENSMUST00000213150 571 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ripk3Q9QZL0 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ripk3Q9QZL0 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ripk3Q9QZL0 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ripk3Q9QZL0 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ripk3Q9QZL0 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ripk3Q9QZL0 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ripk3Q9QZL0 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ripk3Q9QZL0 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ripk3Q9QZL0 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ripk3Q9QZL0 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ripk3Q9QZL0 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ripk3Q9QZL0 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ripk3Q9QZL0 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ripk3Q9QZL0 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ripk3Q9QZL0 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ripk3Q9QZL0 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ripk3Q9QZL0 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ripk3Q9QZL0 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ripk3Q9QZL0 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ripk3Q9QZL0 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ripk3Q9QZL0 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ripk3Q9QZL0 Ighv1-52-201ENSMUST00000103522 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ripk3Q9QZL0 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ripk3Q9QZL0 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ripk3Q9QZL0 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ripk3Q9QZL0 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ripk3Q9QZL0 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ripk3Q9QZL0 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ripk3Q9QZL0 Fam92b-201ENSMUST00000048786 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ripk3Q9QZL0 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ripk3Q9QZL0 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ripk3Q9QZL0 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ripk3Q9QZL0 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ripk3Q9QZL0 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ripk3Q9QZL0 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ripk3Q9QZL0 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ripk3Q9QZL0 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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Ripk3Q9QZL0 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ripk3Q9QZL0 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ripk3Q9QZL0 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ripk3Q9QZL0 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ripk3Q9QZL0 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ripk3Q9QZL0 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ripk3Q9QZL0 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ripk3Q9QZL0 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ripk3Q9QZL0 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ripk3Q9QZL0 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ripk3Q9QZL0 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ripk3Q9QZL0 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ripk3Q9QZL0 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ripk3Q9QZL0 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ripk3Q9QZL0 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ripk3Q9QZL0 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ripk3Q9QZL0 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ripk3Q9QZL0 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ripk3Q9QZL0 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ripk3Q9QZL0 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ripk3Q9QZL0 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ripk3Q9QZL0 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ripk3Q9QZL0 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ripk3Q9QZL0 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ripk3Q9QZL0 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ripk3Q9QZL0 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ripk3Q9QZL0 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ripk3Q9QZL0 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms