Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ47

Tnnt3, Troponin T, fast skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt3Q9QZ47 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tnnt3Q9QZ47 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tnnt3Q9QZ47 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tnnt3Q9QZ47 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tnnt3Q9QZ47 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tnnt3Q9QZ47 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Tnnt3Q9QZ47 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tnnt3Q9QZ47 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tnnt3Q9QZ47 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tnnt3Q9QZ47 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tnnt3Q9QZ47 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tnnt3Q9QZ47 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Tnnt3Q9QZ47 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Tnnt3Q9QZ47 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Tnnt3Q9QZ47 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tnnt3Q9QZ47 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tnnt3Q9QZ47 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tnnt3Q9QZ47 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tnnt3Q9QZ47 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tnnt3Q9QZ47 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tnnt3Q9QZ47 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Tnnt3Q9QZ47 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Tnnt3Q9QZ47 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Tnnt3Q9QZ47 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tnnt3Q9QZ47 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tnnt3Q9QZ47 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tnnt3Q9QZ47 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tnnt3Q9QZ47 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tnnt3Q9QZ47 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tnnt3Q9QZ47 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tnnt3Q9QZ47 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tnnt3Q9QZ47 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tnnt3Q9QZ47 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tnnt3Q9QZ47 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tnnt3Q9QZ47 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Tnnt3Q9QZ47 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tnnt3Q9QZ47 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tnnt3Q9QZ47 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tnnt3Q9QZ47 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tnnt3Q9QZ47 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tnnt3Q9QZ47 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tnnt3Q9QZ47 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tnnt3Q9QZ47 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tnnt3Q9QZ47 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tnnt3Q9QZ47 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Tnnt3Q9QZ47 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Tnnt3Q9QZ47 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tnnt3Q9QZ47 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tnnt3Q9QZ47 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tnnt3Q9QZ47 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tnnt3Q9QZ47 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tnnt3Q9QZ47 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tnnt3Q9QZ47 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tnnt3Q9QZ47 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tnnt3Q9QZ47 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tnnt3Q9QZ47 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tnnt3Q9QZ47 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Tnnt3Q9QZ47 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tnnt3Q9QZ47 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tnnt3Q9QZ47 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tnnt3Q9QZ47 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tnnt3Q9QZ47 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tnnt3Q9QZ47 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Tnnt3Q9QZ47 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tnnt3Q9QZ47 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tnnt3Q9QZ47 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tnnt3Q9QZ47 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tnnt3Q9QZ47 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tnnt3Q9QZ47 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tnnt3Q9QZ47 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Tnnt3Q9QZ47 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tnnt3Q9QZ47 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tnnt3Q9QZ47 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Tnnt3Q9QZ47 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Tnnt3Q9QZ47 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tnnt3Q9QZ47 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tnnt3Q9QZ47 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tnnt3Q9QZ47 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tnnt3Q9QZ47 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tnnt3Q9QZ47 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tnnt3Q9QZ47 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tnnt3Q9QZ47 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tnnt3Q9QZ47 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tnnt3Q9QZ47 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tnnt3Q9QZ47 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Tnnt3Q9QZ47 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tnnt3Q9QZ47 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tnnt3Q9QZ47 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tnnt3Q9QZ47 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tnnt3Q9QZ47 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tnnt3Q9QZ47 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tnnt3Q9QZ47 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tnnt3Q9QZ47 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tnnt3Q9QZ47 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tnnt3Q9QZ47 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tnnt3Q9QZ47 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tnnt3Q9QZ47 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tnnt3Q9QZ47 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tnnt3Q9QZ47 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tnnt3Q9QZ47 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms