Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXZ7

Nr2e3, Photoreceptor-specific nuclear receptor, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr2e3Q9QXZ7 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nr2e3Q9QXZ7 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Nr2e3Q9QXZ7 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nr2e3Q9QXZ7 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nr2e3Q9QXZ7 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nr2e3Q9QXZ7 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nr2e3Q9QXZ7 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nr2e3Q9QXZ7 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nr2e3Q9QXZ7 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nr2e3Q9QXZ7 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nr2e3Q9QXZ7 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nr2e3Q9QXZ7 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nr2e3Q9QXZ7 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nr2e3Q9QXZ7 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nr2e3Q9QXZ7 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nr2e3Q9QXZ7 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nr2e3Q9QXZ7 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nr2e3Q9QXZ7 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nr2e3Q9QXZ7 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nr2e3Q9QXZ7 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nr2e3Q9QXZ7 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Nr2e3Q9QXZ7 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nr2e3Q9QXZ7 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nr2e3Q9QXZ7 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nr2e3Q9QXZ7 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nr2e3Q9QXZ7 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nr2e3Q9QXZ7 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Nr2e3Q9QXZ7 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nr2e3Q9QXZ7 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nr2e3Q9QXZ7 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nr2e3Q9QXZ7 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nr2e3Q9QXZ7 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nr2e3Q9QXZ7 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nr2e3Q9QXZ7 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nr2e3Q9QXZ7 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nr2e3Q9QXZ7 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nr2e3Q9QXZ7 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nr2e3Q9QXZ7 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nr2e3Q9QXZ7 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nr2e3Q9QXZ7 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nr2e3Q9QXZ7 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nr2e3Q9QXZ7 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nr2e3Q9QXZ7 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nr2e3Q9QXZ7 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Nr2e3Q9QXZ7 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Nr2e3Q9QXZ7 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Nr2e3Q9QXZ7 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Nr2e3Q9QXZ7 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Nr2e3Q9QXZ7 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nr2e3Q9QXZ7 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nr2e3Q9QXZ7 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nr2e3Q9QXZ7 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nr2e3Q9QXZ7 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nr2e3Q9QXZ7 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nr2e3Q9QXZ7 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nr2e3Q9QXZ7 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nr2e3Q9QXZ7 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Nr2e3Q9QXZ7 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Nr2e3Q9QXZ7 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nr2e3Q9QXZ7 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nr2e3Q9QXZ7 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nr2e3Q9QXZ7 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nr2e3Q9QXZ7 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nr2e3Q9QXZ7 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nr2e3Q9QXZ7 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nr2e3Q9QXZ7 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nr2e3Q9QXZ7 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nr2e3Q9QXZ7 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nr2e3Q9QXZ7 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nr2e3Q9QXZ7 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nr2e3Q9QXZ7 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Nr2e3Q9QXZ7 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nr2e3Q9QXZ7 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nr2e3Q9QXZ7 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nr2e3Q9QXZ7 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nr2e3Q9QXZ7 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Nr2e3Q9QXZ7 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nr2e3Q9QXZ7 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nr2e3Q9QXZ7 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nr2e3Q9QXZ7 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Nr2e3Q9QXZ7 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nr2e3Q9QXZ7 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nr2e3Q9QXZ7 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nr2e3Q9QXZ7 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nr2e3Q9QXZ7 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nr2e3Q9QXZ7 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nr2e3Q9QXZ7 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nr2e3Q9QXZ7 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nr2e3Q9QXZ7 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nr2e3Q9QXZ7 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nr2e3Q9QXZ7 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nr2e3Q9QXZ7 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nr2e3Q9QXZ7 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Nr2e3Q9QXZ7 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nr2e3Q9QXZ7 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nr2e3Q9QXZ7 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nr2e3Q9QXZ7 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nr2e3Q9QXZ7 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nr2e3Q9QXZ7 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nr2e3Q9QXZ7 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79 ms