Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMD1

Sfmbt1, Scm-like with four MBT domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfmbt1Q9JMD1 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sfmbt1Q9JMD1 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sfmbt1Q9JMD1 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sfmbt1Q9JMD1 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sfmbt1Q9JMD1 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sfmbt1Q9JMD1 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sfmbt1Q9JMD1 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sfmbt1Q9JMD1 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sfmbt1Q9JMD1 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sfmbt1Q9JMD1 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sfmbt1Q9JMD1 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sfmbt1Q9JMD1 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sfmbt1Q9JMD1 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sfmbt1Q9JMD1 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sfmbt1Q9JMD1 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sfmbt1Q9JMD1 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sfmbt1Q9JMD1 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sfmbt1Q9JMD1 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sfmbt1Q9JMD1 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sfmbt1Q9JMD1 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Sfmbt1Q9JMD1 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sfmbt1Q9JMD1 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sfmbt1Q9JMD1 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sfmbt1Q9JMD1 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sfmbt1Q9JMD1 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sfmbt1Q9JMD1 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sfmbt1Q9JMD1 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sfmbt1Q9JMD1 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sfmbt1Q9JMD1 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sfmbt1Q9JMD1 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Sfmbt1Q9JMD1 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sfmbt1Q9JMD1 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sfmbt1Q9JMD1 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sfmbt1Q9JMD1 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sfmbt1Q9JMD1 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sfmbt1Q9JMD1 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Sfmbt1Q9JMD1 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sfmbt1Q9JMD1 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sfmbt1Q9JMD1 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sfmbt1Q9JMD1 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sfmbt1Q9JMD1 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sfmbt1Q9JMD1 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Sfmbt1Q9JMD1 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Sfmbt1Q9JMD1 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Sfmbt1Q9JMD1 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Sfmbt1Q9JMD1 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Sfmbt1Q9JMD1 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sfmbt1Q9JMD1 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Sfmbt1Q9JMD1 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Sfmbt1Q9JMD1 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Sfmbt1Q9JMD1 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Sfmbt1Q9JMD1 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Sfmbt1Q9JMD1 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sfmbt1Q9JMD1 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Sfmbt1Q9JMD1 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sfmbt1Q9JMD1 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sfmbt1Q9JMD1 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sfmbt1Q9JMD1 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sfmbt1Q9JMD1 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sfmbt1Q9JMD1 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sfmbt1Q9JMD1 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sfmbt1Q9JMD1 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sfmbt1Q9JMD1 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sfmbt1Q9JMD1 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sfmbt1Q9JMD1 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sfmbt1Q9JMD1 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Sfmbt1Q9JMD1 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sfmbt1Q9JMD1 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sfmbt1Q9JMD1 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sfmbt1Q9JMD1 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sfmbt1Q9JMD1 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sfmbt1Q9JMD1 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Sfmbt1Q9JMD1 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sfmbt1Q9JMD1 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sfmbt1Q9JMD1 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sfmbt1Q9JMD1 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sfmbt1Q9JMD1 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sfmbt1Q9JMD1 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sfmbt1Q9JMD1 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sfmbt1Q9JMD1 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sfmbt1Q9JMD1 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sfmbt1Q9JMD1 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sfmbt1Q9JMD1 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sfmbt1Q9JMD1 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sfmbt1Q9JMD1 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Sfmbt1Q9JMD1 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sfmbt1Q9JMD1 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sfmbt1Q9JMD1 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sfmbt1Q9JMD1 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sfmbt1Q9JMD1 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sfmbt1Q9JMD1 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sfmbt1Q9JMD1 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sfmbt1Q9JMD1 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Sfmbt1Q9JMD1 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Sfmbt1Q9JMD1 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Sfmbt1Q9JMD1 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sfmbt1Q9JMD1 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sfmbt1Q9JMD1 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sfmbt1Q9JMD1 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sfmbt1Q9JMD1 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms