Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLK7

Cabp1, Calcium-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cabp1Q9JLK7 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cabp1Q9JLK7 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Cabp1Q9JLK7 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cabp1Q9JLK7 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Cabp1Q9JLK7 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Cabp1Q9JLK7 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Cabp1Q9JLK7 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cabp1Q9JLK7 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cabp1Q9JLK7 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cabp1Q9JLK7 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cabp1Q9JLK7 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cabp1Q9JLK7 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cabp1Q9JLK7 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cabp1Q9JLK7 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cabp1Q9JLK7 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cabp1Q9JLK7 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cabp1Q9JLK7 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cabp1Q9JLK7 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cabp1Q9JLK7 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cabp1Q9JLK7 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cabp1Q9JLK7 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cabp1Q9JLK7 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cabp1Q9JLK7 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cabp1Q9JLK7 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Cabp1Q9JLK7 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cabp1Q9JLK7 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cabp1Q9JLK7 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cabp1Q9JLK7 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cabp1Q9JLK7 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cabp1Q9JLK7 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cabp1Q9JLK7 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cabp1Q9JLK7 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cabp1Q9JLK7 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cabp1Q9JLK7 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cabp1Q9JLK7 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cabp1Q9JLK7 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cabp1Q9JLK7 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Cabp1Q9JLK7 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cabp1Q9JLK7 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cabp1Q9JLK7 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cabp1Q9JLK7 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cabp1Q9JLK7 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cabp1Q9JLK7 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cabp1Q9JLK7 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cabp1Q9JLK7 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cabp1Q9JLK7 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cabp1Q9JLK7 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cabp1Q9JLK7 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Cabp1Q9JLK7 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cabp1Q9JLK7 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Cabp1Q9JLK7 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Cabp1Q9JLK7 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cabp1Q9JLK7 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cabp1Q9JLK7 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cabp1Q9JLK7 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cabp1Q9JLK7 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cabp1Q9JLK7 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cabp1Q9JLK7 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cabp1Q9JLK7 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cabp1Q9JLK7 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cabp1Q9JLK7 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cabp1Q9JLK7 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cabp1Q9JLK7 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cabp1Q9JLK7 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cabp1Q9JLK7 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cabp1Q9JLK7 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cabp1Q9JLK7 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cabp1Q9JLK7 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cabp1Q9JLK7 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cabp1Q9JLK7 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cabp1Q9JLK7 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cabp1Q9JLK7 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cabp1Q9JLK7 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cabp1Q9JLK7 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cabp1Q9JLK7 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Cabp1Q9JLK7 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cabp1Q9JLK7 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Cabp1Q9JLK7 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Cabp1Q9JLK7 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cabp1Q9JLK7 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cabp1Q9JLK7 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cabp1Q9JLK7 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cabp1Q9JLK7 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cabp1Q9JLK7 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cabp1Q9JLK7 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cabp1Q9JLK7 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cabp1Q9JLK7 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cabp1Q9JLK7 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cabp1Q9JLK7 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cabp1Q9JLK7 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cabp1Q9JLK7 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cabp1Q9JLK7 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cabp1Q9JLK7 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cabp1Q9JLK7 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cabp1Q9JLK7 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Cabp1Q9JLK7 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Cabp1Q9JLK7 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Cabp1Q9JLK7 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Cabp1Q9JLK7 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Cabp1Q9JLK7 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.7 ms