Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL95

Prg3, Proteoglycan 3, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prg3Q9JL95 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prg3Q9JL95 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prg3Q9JL95 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prg3Q9JL95 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prg3Q9JL95 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prg3Q9JL95 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prg3Q9JL95 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prg3Q9JL95 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prg3Q9JL95 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prg3Q9JL95 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prg3Q9JL95 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prg3Q9JL95 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prg3Q9JL95 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prg3Q9JL95 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prg3Q9JL95 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Prg3Q9JL95 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Prg3Q9JL95 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prg3Q9JL95 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prg3Q9JL95 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prg3Q9JL95 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Prg3Q9JL95 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prg3Q9JL95 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prg3Q9JL95 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prg3Q9JL95 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prg3Q9JL95 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prg3Q9JL95 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prg3Q9JL95 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prg3Q9JL95 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prg3Q9JL95 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prg3Q9JL95 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Prg3Q9JL95 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prg3Q9JL95 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prg3Q9JL95 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Prg3Q9JL95 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prg3Q9JL95 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prg3Q9JL95 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prg3Q9JL95 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prg3Q9JL95 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prg3Q9JL95 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prg3Q9JL95 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prg3Q9JL95 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Prg3Q9JL95 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prg3Q9JL95 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prg3Q9JL95 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Prg3Q9JL95 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prg3Q9JL95 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prg3Q9JL95 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prg3Q9JL95 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prg3Q9JL95 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prg3Q9JL95 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Prg3Q9JL95 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Prg3Q9JL95 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prg3Q9JL95 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prg3Q9JL95 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prg3Q9JL95 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prg3Q9JL95 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prg3Q9JL95 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prg3Q9JL95 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prg3Q9JL95 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Prg3Q9JL95 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prg3Q9JL95 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prg3Q9JL95 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prg3Q9JL95 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prg3Q9JL95 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prg3Q9JL95 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prg3Q9JL95 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prg3Q9JL95 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prg3Q9JL95 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Prg3Q9JL95 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prg3Q9JL95 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prg3Q9JL95 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prg3Q9JL95 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prg3Q9JL95 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prg3Q9JL95 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prg3Q9JL95 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prg3Q9JL95 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prg3Q9JL95 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prg3Q9JL95 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prg3Q9JL95 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Prg3Q9JL95 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Prg3Q9JL95 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prg3Q9JL95 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prg3Q9JL95 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Prg3Q9JL95 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prg3Q9JL95 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prg3Q9JL95 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prg3Q9JL95 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prg3Q9JL95 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Prg3Q9JL95 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms