Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL56

Gde1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, mousemouse

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gde1Q9JL56 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
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Gde1Q9JL56 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Gde1Q9JL56 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Gde1Q9JL56 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Gde1Q9JL56 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gde1Q9JL56 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Gde1Q9JL56 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gde1Q9JL56 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gde1Q9JL56 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Gde1Q9JL56 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Gde1Q9JL56 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Gde1Q9JL56 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Gde1Q9JL56 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Gde1Q9JL56 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
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Gde1Q9JL56 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gde1Q9JL56 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gde1Q9JL56 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gde1Q9JL56 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gde1Q9JL56 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gde1Q9JL56 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gde1Q9JL56 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gde1Q9JL56 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gde1Q9JL56 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gde1Q9JL56 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gde1Q9JL56 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gde1Q9JL56 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gde1Q9JL56 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gde1Q9JL56 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
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Gde1Q9JL56 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gde1Q9JL56 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
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