Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKS4

Ldb3, LIM domain-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb3Q9JKS4 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ldb3Q9JKS4 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ldb3Q9JKS4 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ldb3Q9JKS4 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Ldb3Q9JKS4 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ldb3Q9JKS4 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ldb3Q9JKS4 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ldb3Q9JKS4 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ldb3Q9JKS4 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ldb3Q9JKS4 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ldb3Q9JKS4 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Ldb3Q9JKS4 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ldb3Q9JKS4 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Ldb3Q9JKS4 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ldb3Q9JKS4 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ldb3Q9JKS4 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ldb3Q9JKS4 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ldb3Q9JKS4 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ldb3Q9JKS4 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ldb3Q9JKS4 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ldb3Q9JKS4 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ldb3Q9JKS4 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ldb3Q9JKS4 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ldb3Q9JKS4 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ldb3Q9JKS4 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Ldb3Q9JKS4 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ldb3Q9JKS4 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ldb3Q9JKS4 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ldb3Q9JKS4 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ldb3Q9JKS4 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ldb3Q9JKS4 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ldb3Q9JKS4 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ldb3Q9JKS4 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ldb3Q9JKS4 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ldb3Q9JKS4 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ldb3Q9JKS4 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Ldb3Q9JKS4 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Ldb3Q9JKS4 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Ldb3Q9JKS4 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ldb3Q9JKS4 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ldb3Q9JKS4 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ldb3Q9JKS4 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ldb3Q9JKS4 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Ldb3Q9JKS4 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ldb3Q9JKS4 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ldb3Q9JKS4 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ldb3Q9JKS4 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ldb3Q9JKS4 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ldb3Q9JKS4 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ldb3Q9JKS4 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ldb3Q9JKS4 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ldb3Q9JKS4 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ldb3Q9JKS4 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ldb3Q9JKS4 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ldb3Q9JKS4 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ldb3Q9JKS4 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ldb3Q9JKS4 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ldb3Q9JKS4 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ldb3Q9JKS4 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ldb3Q9JKS4 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ldb3Q9JKS4 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ldb3Q9JKS4 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ldb3Q9JKS4 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ldb3Q9JKS4 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ldb3Q9JKS4 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ldb3Q9JKS4 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ldb3Q9JKS4 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ldb3Q9JKS4 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ldb3Q9JKS4 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ldb3Q9JKS4 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ldb3Q9JKS4 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ldb3Q9JKS4 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ldb3Q9JKS4 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Ldb3Q9JKS4 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Ldb3Q9JKS4 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ldb3Q9JKS4 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ldb3Q9JKS4 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ldb3Q9JKS4 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ldb3Q9JKS4 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ldb3Q9JKS4 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ldb3Q9JKS4 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ldb3Q9JKS4 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ldb3Q9JKS4 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ldb3Q9JKS4 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Ldb3Q9JKS4 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ldb3Q9JKS4 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ldb3Q9JKS4 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ldb3Q9JKS4 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ldb3Q9JKS4 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ldb3Q9JKS4 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ldb3Q9JKS4 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ldb3Q9JKS4 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ldb3Q9JKS4 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ldb3Q9JKS4 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ldb3Q9JKS4 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ldb3Q9JKS4 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ldb3Q9JKS4 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ldb3Q9JKS4 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ldb3Q9JKS4 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ldb3Q9JKS4 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms