Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKF6

Nectin1, Nectin-1, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nectin1Q9JKF6 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nectin1Q9JKF6 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nectin1Q9JKF6 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nectin1Q9JKF6 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nectin1Q9JKF6 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nectin1Q9JKF6 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Nectin1Q9JKF6 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nectin1Q9JKF6 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nectin1Q9JKF6 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nectin1Q9JKF6 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Nectin1Q9JKF6 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nectin1Q9JKF6 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nectin1Q9JKF6 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nectin1Q9JKF6 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nectin1Q9JKF6 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nectin1Q9JKF6 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nectin1Q9JKF6 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nectin1Q9JKF6 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nectin1Q9JKF6 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nectin1Q9JKF6 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Nectin1Q9JKF6 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nectin1Q9JKF6 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Nectin1Q9JKF6 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Nectin1Q9JKF6 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Nectin1Q9JKF6 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nectin1Q9JKF6 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nectin1Q9JKF6 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nectin1Q9JKF6 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nectin1Q9JKF6 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nectin1Q9JKF6 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nectin1Q9JKF6 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nectin1Q9JKF6 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nectin1Q9JKF6 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nectin1Q9JKF6 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nectin1Q9JKF6 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Nectin1Q9JKF6 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nectin1Q9JKF6 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nectin1Q9JKF6 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nectin1Q9JKF6 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nectin1Q9JKF6 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nectin1Q9JKF6 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nectin1Q9JKF6 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nectin1Q9JKF6 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nectin1Q9JKF6 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nectin1Q9JKF6 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nectin1Q9JKF6 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nectin1Q9JKF6 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nectin1Q9JKF6 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nectin1Q9JKF6 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nectin1Q9JKF6 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nectin1Q9JKF6 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nectin1Q9JKF6 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nectin1Q9JKF6 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nectin1Q9JKF6 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nectin1Q9JKF6 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nectin1Q9JKF6 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nectin1Q9JKF6 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nectin1Q9JKF6 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nectin1Q9JKF6 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nectin1Q9JKF6 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Nectin1Q9JKF6 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nectin1Q9JKF6 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nectin1Q9JKF6 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nectin1Q9JKF6 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nectin1Q9JKF6 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Nectin1Q9JKF6 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Nectin1Q9JKF6 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nectin1Q9JKF6 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nectin1Q9JKF6 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nectin1Q9JKF6 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nectin1Q9JKF6 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Nectin1Q9JKF6 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nectin1Q9JKF6 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nectin1Q9JKF6 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nectin1Q9JKF6 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nectin1Q9JKF6 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nectin1Q9JKF6 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nectin1Q9JKF6 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nectin1Q9JKF6 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nectin1Q9JKF6 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nectin1Q9JKF6 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nectin1Q9JKF6 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nectin1Q9JKF6 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nectin1Q9JKF6 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nectin1Q9JKF6 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nectin1Q9JKF6 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nectin1Q9JKF6 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nectin1Q9JKF6 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nectin1Q9JKF6 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nectin1Q9JKF6 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nectin1Q9JKF6 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nectin1Q9JKF6 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nectin1Q9JKF6 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nectin1Q9JKF6 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nectin1Q9JKF6 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nectin1Q9JKF6 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nectin1Q9JKF6 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nectin1Q9JKF6 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nectin1Q9JKF6 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nectin1Q9JKF6 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.8 ms