Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESD7

Dysf, Dysferlin, mousemouse

Predictions only

Length 2,090 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DysfQ9ESD7 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
DysfQ9ESD7 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
DysfQ9ESD7 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
DysfQ9ESD7 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
DysfQ9ESD7 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
DysfQ9ESD7 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
DysfQ9ESD7 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
DysfQ9ESD7 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
DysfQ9ESD7 Gm14662-201ENSMUST00000145552 734 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
DysfQ9ESD7 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
DysfQ9ESD7 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
DysfQ9ESD7 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
DysfQ9ESD7 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
DysfQ9ESD7 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
DysfQ9ESD7 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
DysfQ9ESD7 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
DysfQ9ESD7 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
DysfQ9ESD7 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
DysfQ9ESD7 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
DysfQ9ESD7 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
DysfQ9ESD7 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
DysfQ9ESD7 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
DysfQ9ESD7 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
DysfQ9ESD7 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
DysfQ9ESD7 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
DysfQ9ESD7 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
DysfQ9ESD7 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
DysfQ9ESD7 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
DysfQ9ESD7 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
DysfQ9ESD7 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
DysfQ9ESD7 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
DysfQ9ESD7 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
DysfQ9ESD7 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
DysfQ9ESD7 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
DysfQ9ESD7 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
DysfQ9ESD7 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
DysfQ9ESD7 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
DysfQ9ESD7 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
DysfQ9ESD7 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
DysfQ9ESD7 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
DysfQ9ESD7 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
DysfQ9ESD7 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
DysfQ9ESD7 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
DysfQ9ESD7 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
DysfQ9ESD7 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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DysfQ9ESD7 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
DysfQ9ESD7 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
DysfQ9ESD7 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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DysfQ9ESD7 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
DysfQ9ESD7 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
DysfQ9ESD7 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
DysfQ9ESD7 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
DysfQ9ESD7 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
DysfQ9ESD7 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
DysfQ9ESD7 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
DysfQ9ESD7 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
DysfQ9ESD7 Gm7593-201ENSMUST00000187246 644 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
DysfQ9ESD7 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
DysfQ9ESD7 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
DysfQ9ESD7 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
DysfQ9ESD7 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
DysfQ9ESD7 Rpl10a-201ENSMUST00000042334 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
DysfQ9ESD7 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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DysfQ9ESD7 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
DysfQ9ESD7 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
DysfQ9ESD7 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
DysfQ9ESD7 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
DysfQ9ESD7 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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DysfQ9ESD7 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
DysfQ9ESD7 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
DysfQ9ESD7 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
DysfQ9ESD7 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
DysfQ9ESD7 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
DysfQ9ESD7 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
DysfQ9ESD7 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
DysfQ9ESD7 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
DysfQ9ESD7 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
DysfQ9ESD7 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
DysfQ9ESD7 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
DysfQ9ESD7 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
DysfQ9ESD7 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC11.9□□□□□ -0.51
DysfQ9ESD7 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
DysfQ9ESD7 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
DysfQ9ESD7 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.51
DysfQ9ESD7 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.51
DysfQ9ESD7 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.51
DysfQ9ESD7 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC11.9□□□□□ -0.51
DysfQ9ESD7 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
DysfQ9ESD7 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
DysfQ9ESD7 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
DysfQ9ESD7 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
DysfQ9ESD7 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
DysfQ9ESD7 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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