Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES97

Rtn3, Reticulon-3, mousemouse

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Length 964 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtn3Q9ES97 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rtn3Q9ES97 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rtn3Q9ES97 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rtn3Q9ES97 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rtn3Q9ES97 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Rtn3Q9ES97 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Rtn3Q9ES97 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Rtn3Q9ES97 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Rtn3Q9ES97 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC14.96□□□□□ -0.02
Rtn3Q9ES97 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rtn3Q9ES97 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rtn3Q9ES97 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rtn3Q9ES97 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rtn3Q9ES97 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rtn3Q9ES97 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rtn3Q9ES97 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rtn3Q9ES97 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rtn3Q9ES97 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rtn3Q9ES97 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rtn3Q9ES97 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rtn3Q9ES97 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rtn3Q9ES97 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rtn3Q9ES97 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rtn3Q9ES97 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Rtn3Q9ES97 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rtn3Q9ES97 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Rtn3Q9ES97 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Rtn3Q9ES97 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rtn3Q9ES97 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Rtn3Q9ES97 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rtn3Q9ES97 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Rtn3Q9ES97 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rtn3Q9ES97 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Rtn3Q9ES97 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rtn3Q9ES97 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Rtn3Q9ES97 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rtn3Q9ES97 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Rtn3Q9ES97 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rtn3Q9ES97 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rtn3Q9ES97 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Rtn3Q9ES97 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rtn3Q9ES97 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rtn3Q9ES97 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rtn3Q9ES97 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rtn3Q9ES97 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rtn3Q9ES97 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rtn3Q9ES97 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Rtn3Q9ES97 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rtn3Q9ES97 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rtn3Q9ES97 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Rtn3Q9ES97 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rtn3Q9ES97 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rtn3Q9ES97 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rtn3Q9ES97 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Rtn3Q9ES97 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rtn3Q9ES97 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rtn3Q9ES97 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rtn3Q9ES97 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rtn3Q9ES97 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rtn3Q9ES97 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rtn3Q9ES97 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rtn3Q9ES97 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rtn3Q9ES97 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rtn3Q9ES97 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rtn3Q9ES97 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rtn3Q9ES97 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rtn3Q9ES97 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rtn3Q9ES97 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rtn3Q9ES97 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rtn3Q9ES97 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rtn3Q9ES97 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rtn3Q9ES97 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rtn3Q9ES97 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rtn3Q9ES97 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms