Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES64

Ush1c, Harmonin, mousemouse

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ush1cQ9ES64 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ush1cQ9ES64 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ush1cQ9ES64 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ush1cQ9ES64 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ush1cQ9ES64 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ush1cQ9ES64 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ush1cQ9ES64 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ush1cQ9ES64 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ush1cQ9ES64 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ush1cQ9ES64 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ush1cQ9ES64 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ush1cQ9ES64 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ush1cQ9ES64 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ush1cQ9ES64 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ush1cQ9ES64 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ush1cQ9ES64 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ush1cQ9ES64 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ush1cQ9ES64 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ush1cQ9ES64 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ush1cQ9ES64 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ush1cQ9ES64 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ush1cQ9ES64 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ush1cQ9ES64 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ush1cQ9ES64 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ush1cQ9ES64 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ush1cQ9ES64 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ush1cQ9ES64 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ush1cQ9ES64 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ush1cQ9ES64 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ush1cQ9ES64 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ush1cQ9ES64 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ush1cQ9ES64 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ush1cQ9ES64 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ush1cQ9ES64 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ush1cQ9ES64 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ush1cQ9ES64 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ush1cQ9ES64 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ush1cQ9ES64 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ush1cQ9ES64 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ush1cQ9ES64 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ush1cQ9ES64 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ush1cQ9ES64 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ush1cQ9ES64 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ush1cQ9ES64 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ush1cQ9ES64 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ush1cQ9ES64 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ush1cQ9ES64 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ush1cQ9ES64 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ush1cQ9ES64 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ush1cQ9ES64 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ush1cQ9ES64 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ush1cQ9ES64 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ush1cQ9ES64 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ush1cQ9ES64 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ush1cQ9ES64 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ush1cQ9ES64 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ush1cQ9ES64 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ush1cQ9ES64 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ush1cQ9ES64 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ush1cQ9ES64 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ush1cQ9ES64 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ush1cQ9ES64 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ush1cQ9ES64 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ush1cQ9ES64 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ush1cQ9ES64 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ush1cQ9ES64 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ush1cQ9ES64 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ush1cQ9ES64 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ush1cQ9ES64 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ush1cQ9ES64 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ush1cQ9ES64 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ush1cQ9ES64 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ush1cQ9ES64 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ush1cQ9ES64 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ush1cQ9ES64 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ush1cQ9ES64 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ush1cQ9ES64 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ush1cQ9ES64 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ush1cQ9ES64 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ush1cQ9ES64 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ush1cQ9ES64 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ush1cQ9ES64 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ush1cQ9ES64 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ush1cQ9ES64 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ush1cQ9ES64 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ush1cQ9ES64 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ush1cQ9ES64 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ush1cQ9ES64 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ush1cQ9ES64 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ush1cQ9ES64 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ush1cQ9ES64 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ush1cQ9ES64 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ush1cQ9ES64 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ush1cQ9ES64 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ush1cQ9ES64 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ush1cQ9ES64 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ush1cQ9ES64 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ush1cQ9ES64 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ush1cQ9ES64 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ush1cQ9ES64 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms