Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES63

Usp29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, mousemouse

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Length 869 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp29Q9ES63 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp29Q9ES63 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp29Q9ES63 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp29Q9ES63 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp29Q9ES63 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp29Q9ES63 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp29Q9ES63 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp29Q9ES63 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp29Q9ES63 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp29Q9ES63 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp29Q9ES63 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp29Q9ES63 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp29Q9ES63 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp29Q9ES63 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp29Q9ES63 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
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Usp29Q9ES63 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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Usp29Q9ES63 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp29Q9ES63 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp29Q9ES63 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp29Q9ES63 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp29Q9ES63 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp29Q9ES63 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp29Q9ES63 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp29Q9ES63 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp29Q9ES63 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp29Q9ES63 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp29Q9ES63 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp29Q9ES63 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp29Q9ES63 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp29Q9ES63 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp29Q9ES63 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Usp29Q9ES63 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp29Q9ES63 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp29Q9ES63 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp29Q9ES63 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp29Q9ES63 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Usp29Q9ES63 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Usp29Q9ES63 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp29Q9ES63 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp29Q9ES63 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Usp29Q9ES63 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp29Q9ES63 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp29Q9ES63 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp29Q9ES63 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Usp29Q9ES63 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Usp29Q9ES63 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp29Q9ES63 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp29Q9ES63 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp29Q9ES63 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp29Q9ES63 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp29Q9ES63 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp29Q9ES63 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp29Q9ES63 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp29Q9ES63 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp29Q9ES63 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp29Q9ES63 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp29Q9ES63 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp29Q9ES63 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp29Q9ES63 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp29Q9ES63 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms