Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERH7

Hipk3, Homeodomain-interacting protein kinase 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,192 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hipk3Q9ERH7 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hipk3Q9ERH7 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hipk3Q9ERH7 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hipk3Q9ERH7 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hipk3Q9ERH7 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Hipk3Q9ERH7 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hipk3Q9ERH7 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hipk3Q9ERH7 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hipk3Q9ERH7 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hipk3Q9ERH7 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hipk3Q9ERH7 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hipk3Q9ERH7 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Hipk3Q9ERH7 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hipk3Q9ERH7 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hipk3Q9ERH7 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hipk3Q9ERH7 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hipk3Q9ERH7 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Hipk3Q9ERH7 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hipk3Q9ERH7 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Hipk3Q9ERH7 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hipk3Q9ERH7 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hipk3Q9ERH7 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hipk3Q9ERH7 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Hipk3Q9ERH7 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hipk3Q9ERH7 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hipk3Q9ERH7 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hipk3Q9ERH7 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hipk3Q9ERH7 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hipk3Q9ERH7 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hipk3Q9ERH7 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Hipk3Q9ERH7 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Hipk3Q9ERH7 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Hipk3Q9ERH7 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Hipk3Q9ERH7 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Hipk3Q9ERH7 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Hipk3Q9ERH7 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Hipk3Q9ERH7 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Hipk3Q9ERH7 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Hipk3Q9ERH7 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Hipk3Q9ERH7 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hipk3Q9ERH7 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hipk3Q9ERH7 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hipk3Q9ERH7 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hipk3Q9ERH7 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hipk3Q9ERH7 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hipk3Q9ERH7 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hipk3Q9ERH7 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hipk3Q9ERH7 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hipk3Q9ERH7 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hipk3Q9ERH7 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hipk3Q9ERH7 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hipk3Q9ERH7 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hipk3Q9ERH7 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Hipk3Q9ERH7 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Hipk3Q9ERH7 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hipk3Q9ERH7 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hipk3Q9ERH7 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hipk3Q9ERH7 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Hipk3Q9ERH7 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hipk3Q9ERH7 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hipk3Q9ERH7 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hipk3Q9ERH7 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Hipk3Q9ERH7 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Hipk3Q9ERH7 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hipk3Q9ERH7 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hipk3Q9ERH7 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hipk3Q9ERH7 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hipk3Q9ERH7 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hipk3Q9ERH7 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hipk3Q9ERH7 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hipk3Q9ERH7 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hipk3Q9ERH7 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hipk3Q9ERH7 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hipk3Q9ERH7 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hipk3Q9ERH7 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hipk3Q9ERH7 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hipk3Q9ERH7 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hipk3Q9ERH7 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hipk3Q9ERH7 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hipk3Q9ERH7 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hipk3Q9ERH7 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hipk3Q9ERH7 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hipk3Q9ERH7 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hipk3Q9ERH7 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hipk3Q9ERH7 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hipk3Q9ERH7 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hipk3Q9ERH7 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hipk3Q9ERH7 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hipk3Q9ERH7 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hipk3Q9ERH7 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hipk3Q9ERH7 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hipk3Q9ERH7 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hipk3Q9ERH7 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Hipk3Q9ERH7 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hipk3Q9ERH7 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hipk3Q9ERH7 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hipk3Q9ERH7 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hipk3Q9ERH7 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hipk3Q9ERH7 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hipk3Q9ERH7 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.8 ms