Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERA0

Tfcp2, Alpha-globin transcription factor CP2, mousemouse

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfcp2Q9ERA0 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tfcp2Q9ERA0 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tfcp2Q9ERA0 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tfcp2Q9ERA0 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tfcp2Q9ERA0 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tfcp2Q9ERA0 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tfcp2Q9ERA0 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tfcp2Q9ERA0 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tfcp2Q9ERA0 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tfcp2Q9ERA0 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tfcp2Q9ERA0 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tfcp2Q9ERA0 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tfcp2Q9ERA0 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Tfcp2Q9ERA0 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tfcp2Q9ERA0 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Tfcp2Q9ERA0 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tfcp2Q9ERA0 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tfcp2Q9ERA0 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tfcp2Q9ERA0 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tfcp2Q9ERA0 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tfcp2Q9ERA0 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tfcp2Q9ERA0 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tfcp2Q9ERA0 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tfcp2Q9ERA0 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tfcp2Q9ERA0 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tfcp2Q9ERA0 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tfcp2Q9ERA0 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tfcp2Q9ERA0 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tfcp2Q9ERA0 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tfcp2Q9ERA0 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tfcp2Q9ERA0 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tfcp2Q9ERA0 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tfcp2Q9ERA0 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tfcp2Q9ERA0 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tfcp2Q9ERA0 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tfcp2Q9ERA0 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tfcp2Q9ERA0 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tfcp2Q9ERA0 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tfcp2Q9ERA0 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tfcp2Q9ERA0 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tfcp2Q9ERA0 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tfcp2Q9ERA0 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tfcp2Q9ERA0 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tfcp2Q9ERA0 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tfcp2Q9ERA0 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tfcp2Q9ERA0 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Tfcp2Q9ERA0 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tfcp2Q9ERA0 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Tfcp2Q9ERA0 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tfcp2Q9ERA0 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tfcp2Q9ERA0 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tfcp2Q9ERA0 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tfcp2Q9ERA0 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tfcp2Q9ERA0 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tfcp2Q9ERA0 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tfcp2Q9ERA0 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tfcp2Q9ERA0 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tfcp2Q9ERA0 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tfcp2Q9ERA0 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tfcp2Q9ERA0 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tfcp2Q9ERA0 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tfcp2Q9ERA0 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Tfcp2Q9ERA0 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tfcp2Q9ERA0 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
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Tfcp2Q9ERA0 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Tfcp2Q9ERA0 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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Tfcp2Q9ERA0 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tfcp2Q9ERA0 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tfcp2Q9ERA0 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tfcp2Q9ERA0 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tfcp2Q9ERA0 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tfcp2Q9ERA0 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tfcp2Q9ERA0 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tfcp2Q9ERA0 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tfcp2Q9ERA0 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tfcp2Q9ERA0 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tfcp2Q9ERA0 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tfcp2Q9ERA0 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tfcp2Q9ERA0 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tfcp2Q9ERA0 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tfcp2Q9ERA0 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tfcp2Q9ERA0 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Tfcp2Q9ERA0 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Tfcp2Q9ERA0 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tfcp2Q9ERA0 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tfcp2Q9ERA0 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tfcp2Q9ERA0 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tfcp2Q9ERA0 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tfcp2Q9ERA0 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tfcp2Q9ERA0 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tfcp2Q9ERA0 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tfcp2Q9ERA0 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tfcp2Q9ERA0 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tfcp2Q9ERA0 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tfcp2Q9ERA0 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tfcp2Q9ERA0 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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